More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4056 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  100 
 
 		 343 aa  686    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  80.58 
 
 		 345 aa  507  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  78.16 
 
 		 348 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  75.8 
 
 		 359 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  75.51 
 
 		 342 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  75.51 
 
 		 342 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  74.78 
 
 		 344 aa  471  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.32 
 
 		 342 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  70.91 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  70.91 
 
 		 341 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  70.91 
 
 		 341 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  68.8 
 
 		 343 aa  431  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  65.06 
 
 		 353 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.06 
 
 		 342 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.7 
 
 		 348 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.25 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  65.14 
 
 		 353 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  64.49 
 
 		 353 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.99 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  65.76 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  65.03 
 
 		 349 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  66.1 
 
 		 354 aa  408  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  62.78 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  64.37 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  64.58 
 
 		 350 aa  404  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.48 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  62.5 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.48 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  69.88 
 
 		 349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.18 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  68.06 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  64.16 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.08 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  65.59 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  64.41 
 
 		 364 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  63.03 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  62.65 
 
 		 332 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  66.67 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  60.52 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  58.14 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  54.35 
 
 		 370 aa  328  7e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  52.44 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  54.7 
 
 		 352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.3 
 
 		 369 aa  326  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  52.72 
 
 		 361 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  52.25 
 
 		 355 aa  322  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  54.95 
 
 		 379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  54.95 
 
 		 357 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  55.26 
 
 		 357 aa  318  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  54.88 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  56.83 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  54.27 
 
 		 407 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  55.45 
 
 		 365 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  53.96 
 
 		 407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  55.76 
 
 		 365 aa  312  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  52.25 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  55.15 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  55.52 
 
 		 406 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  57.23 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  55.21 
 
 		 406 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.75 
 
 		 371 aa  309  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  54.85 
 
 		 364 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  50.85 
 
 		 357 aa  309  5e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3915  GTPase ObgE  51.11 
 
 		 363 aa  309  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0260013 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  50.85 
 
 		 357 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  54.82 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  54.38 
 
 		 338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.6 
 
 		 356 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.63 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  49.58 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  51.01 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  53.11 
 
 		 362 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  51.3 
 
 		 408 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  55.22 
 
 		 370 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  51.3 
 
 		 408 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  54.35 
 
 		 347 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  51.3 
 
 		 408 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  55.05 
 
 		 345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  51.16 
 
 		 363 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  52.6 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  50.72 
 
 		 408 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.84 
 
 		 458 aa  301  7.000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  52.29 
 
 		 370 aa  301  8.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  51.82 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.58 
 
 		 350 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  55.42 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  55.42 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  55.42 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  55.42 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  55.42 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  55.42 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  55.42 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  52.99 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  54.01 
 
 		 373 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  53.29 
 
 		 373 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  51.04 
 
 		 341 aa  298  7e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  51.38 
 
 		 326 aa  298  7e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  54.46 
 
 		 389 aa  297  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  50.29 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>