More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3901 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3901  ATPase  100 
 
 		 333 aa  654    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  71.43 
 
 		 338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  70.27 
 
 		 338 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  70.27 
 
 		 338 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  67.91 
 
 		 335 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  66.04 
 
 		 335 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  66.98 
 
 		 335 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.8 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  65.9 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.78 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  62.23 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  64.2 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.23 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.23 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  62.62 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  65.15 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  64.8 
 
 		 334 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  62.7 
 
 		 346 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  65.91 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  62.11 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  60.49 
 
 		 335 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  61.7 
 
 		 332 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  57.27 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  62.58 
 
 		 333 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  66.78 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  60.49 
 
 		 335 aa  381  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  60.8 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.16 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  63.82 
 
 		 332 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  65.69 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  64.14 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  61.85 
 
 		 340 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  65.26 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  60.19 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.64 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.66 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.94 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  48.74 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  47.17 
 
 		 317 aa  314  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.33 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.1 
 
 		 327 aa  309  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.53 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  48.69 
 
 		 321 aa  305  9.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.36 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.11 
 
 		 351 aa  301  9e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  49.38 
 
 		 356 aa  301  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 		 379 aa  298  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 		 341 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 		 349 aa  293  3e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 		 341 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  49.18 
 
 		 343 aa  291  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  49.83 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.86 
 
 		 320 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.65 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.78 
 
 		 341 aa  286  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.85 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.66 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  46.79 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  45.75 
 
 		 318 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.45 
 
 		 313 aa  272  7e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  46.82 
 
 		 324 aa  271  9e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.4 
 
 		 345 aa  271  9e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  46.28 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.63 
 
 		 325 aa  265  7e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.33 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  43.61 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.16 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  41.72 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.09 
 
 		 334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.51 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.83 
 
 		 342 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.42 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  43.56 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.04 
 
 		 309 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  49.51 
 
 		 320 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  45.77 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  43.81 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  46.37 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  47.02 
 
 		 353 aa  242  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  45.45 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  43.17 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  43.73 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.08 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.41 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  47.44 
 
 		 336 aa  238  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  45.34 
 
 		 328 aa  238  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  44.48 
 
 		 333 aa  238  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  44.48 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  47.11 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  44.86 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.42 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.65 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  48.7 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  48.7 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  48.7 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  41.61 
 
 		 340 aa  237  3e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  44.16 
 
 		 333 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  43.81 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>