110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3814 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  58.98 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  58.98 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  59.18 
 
 		 248 aa  292  4e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  59.18 
 
 		 256 aa  292  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  57.66 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  52.92 
 
 		 253 aa  269  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  41.13 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  40.26 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  43.18 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  40.08 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  41.09 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  41.52 
 
 		 264 aa  168  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  42.98 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  41.85 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  43.18 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  40.47 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  39.24 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  39.24 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  43.29 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  40.64 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  38.36 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  41.41 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  38.29 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  39.21 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  37.24 
 
 		 250 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  38.91 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  38.28 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  37.5 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  34.92 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  31.75 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  36.29 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  30.65 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  30.65 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  30.65 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  30.22 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  30.65 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  32.33 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  34.4 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  29.84 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  28.33 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  29.37 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  28.33 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  28.89 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  28.33 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  28.33 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  28.33 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  28.33 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  28.33 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  29.26 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  28.18 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  31.34 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3482  hypothetical protein  30.83 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  35.14 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  35.14 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3713  hypothetical protein  29.57 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  30.16 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  27.71 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  26.67 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  40.48 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.25 
 
 		 230 aa  49.3  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 270 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 312 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  28.48 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  30.83 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  34 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 222 aa  45.8  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  29.41 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1535  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  34.62 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  32 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1830  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  40.35 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 802 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>