More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3813 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
248 aa  501  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.9 
 
 
255 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  54.51 
 
 
255 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.12 
 
 
255 aa  255  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.15 
 
 
256 aa  249  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  50.59 
 
 
256 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.83 
 
 
256 aa  228  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.63 
 
 
271 aa  222  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.8 
 
 
242 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  43.92 
 
 
255 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.06 
 
 
260 aa  216  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  45.06 
 
 
257 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.06 
 
 
256 aa  216  3e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.09 
 
 
278 aa  212  4e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  44.09 
 
 
256 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.25 
 
 
260 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  46.06 
 
 
256 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.53 
 
 
256 aa  201  1e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.9 
 
 
256 aa  199  2e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.09 
 
 
255 aa  200  2e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  41.94 
 
 
262 aa  199  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.94 
 
 
256 aa  199  4e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.66 
 
 
259 aa  197  1e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.5 
 
 
255 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 
255 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.27 
 
 
259 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.56 
 
 
256 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.97 
 
 
282 aa  191  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.87 
 
 
259 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  41.73 
 
 
255 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.65 
 
 
242 aa  189  3e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.31 
 
 
256 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.66 
 
 
263 aa  188  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.71 
 
 
255 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.97 
 
 
272 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 
254 aa  185  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.57 
 
 
258 aa  183  2e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.41 
 
 
250 aa  182  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  40.41 
 
 
255 aa  181  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.52 
 
 
256 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.25 
 
 
248 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.86 
 
 
256 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.18 
 
 
254 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.23 
 
 
257 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.46 
 
 
257 aa  174  1e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  42.91 
 
 
252 aa  174  1e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 
258 aa  174  2e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.19 
 
 
255 aa  174  2e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.08 
 
 
257 aa  173  2e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.46 
 
 
259 aa  173  3e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.8 
 
 
255 aa  173  3e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.85 
 
 
259 aa  172  3e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.98 
 
 
259 aa  172  3e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.48 
 
 
266 aa  172  4e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.82 
 
 
255 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.11 
 
 
258 aa  172  6e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.76 
 
 
263 aa  171  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.06 
 
 
259 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.46 
 
 
259 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  42.86 
 
 
259 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  40.3 
 
 
265 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.06 
 
 
259 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.62 
 
 
258 aa  168  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  42.48 
 
 
266 aa  166  3e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  42.44 
 
 
284 aa  165  6e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.52 
 
 
257 aa  164  1e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.4 
 
 
257 aa  163  2e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.02 
 
 
255 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.7 
 
 
259 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  37.35 
 
 
257 aa  162  4e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.47 
 
 
259 aa  162  4e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.69 
 
 
259 aa  162  5e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.23 
 
 
258 aa  162  5e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.75 
 
 
267 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.31 
 
 
259 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.02 
 
 
254 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.07 
 
 
251 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  35.07 
 
 
251 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.61 
 
 
252 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.93 
 
 
257 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.23 
 
 
258 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  37.93 
 
 
257 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.23 
 
 
258 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  35.07 
 
 
280 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.94 
 
 
246 aa  158  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  38.04 
 
 
252 aa  158  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.98 
 
 
263 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  42.86 
 
 
255 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.61 
 
 
252 aa  155  5e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.61 
 
 
263 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.23 
 
 
266 aa  155  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.08 
 
 
255 aa  155  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.58 
 
 
257 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.97 
 
 
250 aa  154  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.94 
 
 
273 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.43e-05  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.23 
 
 
264 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.03 
 
 
258 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  36.02 
 
 
265 aa  153  3e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1778  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.78 
 
 
243 aa  153  3e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0392485  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1432  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.88 
 
 
259 aa  151  9e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.949505  normal  0.289854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>