173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3790 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3790  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.195519  normal  0.0197578 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3586  putative aromatic pathway regulator  58.22 
 
 
148 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3271  GCN5-related N-acetyltransferase  57.53 
 
 
148 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.340113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0265  GCN5-related N-acetyltransferase  45.64 
 
 
160 aa  133  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5542  GCN5-related N-acetyltransferase  43.71 
 
 
152 aa  130  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3886  hypothetical protein  56.16 
 
 
148 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.680311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8955  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316423  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4002  GCN5-related N-acetyltransferase  45.7 
 
 
179 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  45.03 
 
 
152 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.499146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3796  GCN5-related N-acetyltransferase  47.59 
 
 
151 aa  121  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.583443  hitchhiker  0.000215605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3783  GCN5-related N-acetyltransferase  43.23 
 
 
163 aa  121  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3909  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4793  GCN5-related N-acetyltransferase  48.28 
 
 
156 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  44.97 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4109  GCN5-related N-acetyltransferase  44.22 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.923761  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1821  hypothetical protein  45.83 
 
 
151 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4072  GCN5-related N-acetyltransferase  44.97 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1544  GCN5-related N-acetyltransferase  46.31 
 
 
163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.405729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2418  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
153 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.05854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6158  GCN5-related N-acetyltransferase  43.54 
 
 
158 aa  106  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0997895  normal  0.166229 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12090  acetyltransferase (GNAT) family protein  43.17 
 
 
157 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.769845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4392  GCN5-related N-acetyltransferase  42.95 
 
 
151 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.896342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3797  GCN5-related N-acetyltransferase  41.06 
 
 
166 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0205  GCN5-related N-acetyltransferase  42.25 
 
 
601 aa  100  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189301  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01508  hypothetical protein  35.37 
 
 
151 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3628  GCN5-related N-acetyltransferase  44.36 
 
 
155 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169906  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1725  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
154 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105748  normal  0.188716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3241  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.519262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1783  acetyltransferase  36.99 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  39.07 
 
 
162 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4741  GCN5-related N-acetyltransferase  51.14 
 
 
120 aa  87  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1530  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
157 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.839822  normal  0.716536 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0140  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.481463  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5485  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194088  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5283  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4633  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  43.28 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4633  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  43.28 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635106  normal  0.946707 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4682  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  43.28 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822416  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4549  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  41.79 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4542  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  41.79 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.772514  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5687  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03965  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  40.3 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3898  GCN5-related N-acetyltransferase  40.3 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2920  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03925  hypothetical protein  40.3 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4647  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  40.3 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3933  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  40.3 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4559  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  40.3 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3192  acetyltransferase  27.89 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0929  putative acetyltransferase  27.07 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4334  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  40.3 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0062  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2293  GCN5-related N-acetyltransferase  31.67 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0395089  normal  0.79144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0191  N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferase  29.25 
 
 
269 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2045  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.67 
 
 
153 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3286  acetyltransferase  30.93 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.867207 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4567  hypothetical protein  31.87 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2281  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0358  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0297  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  37.31 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.216533 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2631  GCN5-related N-acetyltransferase  33.66 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.512633  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3993  GCN5-related protein N-acetyltransferase  31.58 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4807  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
182 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370573  normal  0.130595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  26.39 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4529  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.822074  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3834  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0378234  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3691  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346698  normal  0.265103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0946  GCN5-related N-acetyltransferase  40.28 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3189  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
145 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0191  acetyltransferase  33.73 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3211  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.220294 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0234  GCN5-related N-acetyltransferase  25.35 
 
 
229 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.149769  normal  0.204982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1761  putatative acetyltransferase  35.44 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  32.29 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0418  acetyltransferase  31.15 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0657723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0363  N-acetylglutamate synthase  32.59 
 
 
444 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00936818  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.29 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129008  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20491  putatative acetyltransferase  35.44 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0667747  normal  0.264372 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2000  GCN5-related N-acetyltransferase  40.3 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.744439  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4860  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.2131e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2497  GCN5-related protein N-acetyltransferase  36.99 
 
 
289 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455734  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  24.77 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2762  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2158  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  41.38 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0157524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3166  acetyltransferase, GNAT family  32.53 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0840877  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1068  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
176 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0830  GCN5-related N-acetyltransferase  25.37 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718411  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0592  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1786  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0212  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
228 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0549808  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3033  GCN5-related N-acetyltransferase  24.76 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4181  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.7 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>