More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3694 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  609  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  64.34 
 
 		 314 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  62.28 
 
 		 315 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  62.91 
 
 		 315 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  62.37 
 
 		 300 aa  319  5e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  67.54 
 
 		 302 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  57.3 
 
 		 312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  45.13 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  43.71 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  38.67 
 
 		 389 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  41.95 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  43.9 
 
 		 382 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  43.9 
 
 		 382 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  48.87 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  40.84 
 
 		 296 aa  203  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  38.64 
 
 		 357 aa  202  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  45.02 
 
 		 373 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  44.02 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  39.76 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  43.68 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  43.51 
 
 		 384 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  40.38 
 
 		 344 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  43.43 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  41.86 
 
 		 375 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  42.41 
 
 		 374 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  42.5 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  44.58 
 
 		 345 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  47.25 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.29 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  41.67 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  43.62 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  39.61 
 
 		 374 aa  175  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  42.03 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  38.67 
 
 		 373 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  39.61 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  43.46 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  44.14 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.75 
 
 		 292 aa  169  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  36.79 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  33.11 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.54 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  39.01 
 
 		 391 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  36.07 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  33.76 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  36.63 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  51.28 
 
 		 420 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  33.77 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  37.73 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  37.23 
 
 		 296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  37.31 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  38.02 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 		 435 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  33.73 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  39.73 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  35.19 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  32.78 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  37.3 
 
 		 434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  38.43 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  38.66 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  37.13 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  34.13 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.89 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  37.19 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3952  CBS domain-containing protein  35.86 
 
 		 423 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  33.7 
 
 		 417 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  35.63 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  34.48 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  34.5 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  36.09 
 
 		 425 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  34.68 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  38.56 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  30.28 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  34.12 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  32.39 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  34.68 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  32.31 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  30.69 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  32.36 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  35.69 
 
 		 444 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  34.05 
 
 		 426 aa  139  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  34.81 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  35.19 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  34.75 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  34.75 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  35.04 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1861  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>