253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3676 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  54.13 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  53.67 
 
 		 228 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  56.88 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  50.46 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  48.44 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  49.77 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  47.57 
 
 		 243 aa  154  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  44.14 
 
 		 263 aa  154  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  45.15 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  44.29 
 
 		 241 aa  148  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  43.38 
 
 		 260 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  44.04 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  42.92 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  42.99 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  40.2 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  36.21 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  39.22 
 
 		 256 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  39.22 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  37.83 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  34.82 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  40.28 
 
 		 239 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  34.82 
 
 		 255 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  37.56 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  36.32 
 
 		 252 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  36.73 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  39.47 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  39.51 
 
 		 278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  37.23 
 
 		 251 aa  131  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  38.83 
 
 		 278 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  30.4 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  33.93 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  34.78 
 
 		 243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  35.68 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  42.56 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  28.45 
 
 		 242 aa  118  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  41.44 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  29.41 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  30.63 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  37.76 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  36.6 
 
 		 198 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  35.29 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  30.99 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  29.91 
 
 		 481 aa  108  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  37.63 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  30.17 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  40 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  26.41 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  29.28 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  27.93 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  38.91 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  33.78 
 
 		 300 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  28.97 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  39.05 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  33.93 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  34.64 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  40.37 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  27.94 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.48 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  35.65 
 
 		 224 aa  98.2  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  33.92 
 
 		 285 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  35.59 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  26.52 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  33.65 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  37.27 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  38.32 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  41.86 
 
 		 243 aa  95.1  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  35.34 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  30.45 
 
 		 301 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  42.98 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  39.18 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  43.24 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  33.19 
 
 		 295 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  33.19 
 
 		 292 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  33.19 
 
 		 292 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  33.19 
 
 		 292 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  33.19 
 
 		 292 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  33.19 
 
 		 292 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  33.19 
 
 		 292 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  33.19 
 
 		 292 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  46.15 
 
 		 254 aa  92.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  25.58 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  31.65 
 
 		 245 aa  91.7  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  25.12 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  30.91 
 
 		 316 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  29.49 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  31.09 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  31.98 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  31.98 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  30.91 
 
 		 295 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  35.51 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  37.66 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  30.91 
 
 		 303 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  23.29 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  26.37 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  23.29 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  33.03 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  23.29 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>