More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3521 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 699 aa  1422    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3330  hypothetical protein  47.96 
 
 		 714 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.641382  normal  0.572781 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3062  TonB-dependent siderophore receptor  46.53 
 
 		 715 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.173013 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3417  TonB dependent outer membrane ferrichrome-iron receptor  46.82 
 
 		 715 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  44.73 
 
 		 797 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  44.22 
 
 		 797 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  44.73 
 
 		 797 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  41.8 
 
 		 708 aa  545  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  37.46 
 
 		 718 aa  426  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 778 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 817 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  33.87 
 
 		 791 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 791 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  33.1 
 
 		 719 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 		 829 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  31.47 
 
 		 740 aa  297  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 706 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3585  ferrichrome receptor precursor protein  32.14 
 
 		 718 aa  294  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.885271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.67 
 
 		 833 aa  294  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 		 733 aa  293  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 821 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  31.83 
 
 		 819 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 799 aa  281  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 723 aa  279  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  29.9 
 
 		 799 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 863 aa  277  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  30.79 
 
 		 771 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 		 829 aa  273  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 699 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  31.66 
 
 		 699 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 771 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 735 aa  270  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  29.44 
 
 		 724 aa  269  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 779 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  29.16 
 
 		 752 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 714 aa  267  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 745 aa  267  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 665 aa  266  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  31.04 
 
 		 696 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 		 701 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 757 aa  265  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 696 aa  265  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  31.01 
 
 		 696 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  31.01 
 
 		 696 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 699 aa  264  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  29.41 
 
 		 747 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 728 aa  264  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  31.01 
 
 		 698 aa  264  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  31.01 
 
 		 696 aa  264  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 812 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  28.81 
 
 		 729 aa  263  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 		 728 aa  263  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 799 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  28.65 
 
 		 729 aa  262  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  29.55 
 
 		 747 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.74 
 
 		 797 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  29 
 
 		 747 aa  262  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  28.61 
 
 		 729 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  30.14 
 
 		 729 aa  261  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  29.47 
 
 		 703 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  29.47 
 
 		 703 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  28.86 
 
 		 747 aa  260  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 794 aa  260  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  28.86 
 
 		 747 aa  260  7e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 820 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.95 
 
 		 806 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3474  ferrichrome receptor precursor protein  29.42 
 
 		 719 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  30.62 
 
 		 808 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1139  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 736 aa  257  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  28.86 
 
 		 745 aa  257  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 806 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 797 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 745 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 		 727 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 740 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 724 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 734 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  30.14 
 
 		 815 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 828 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 717 aa  253  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  29.21 
 
 		 747 aa  253  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  30.4 
 
 		 733 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 		 769 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 705 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 		 784 aa  252  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 		 828 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 696 aa  250  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 		 828 aa  250  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 808 aa  250  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 		 828 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 784 aa  249  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 747 aa  248  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  28.86 
 
 		 747 aa  248  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 701 aa  248  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 738 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 802 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 810 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  28.39 
 
 		 753 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  28.39 
 
 		 753 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 737 aa  244  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>