More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3512 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  302  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  68.38 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  50.38 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  48.59 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 		 151 aa  97.1  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 169 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  35.76 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 154 aa  84  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  35.88 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  37.98 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  41.6 
 
 		 210 aa  77.4  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  41.11 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  41.11 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 160 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  30.07 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  30.34 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  30.07 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  30.07 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  30.07 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  30.07 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  30.07 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  30.07 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  29.86 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  29.86 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  29.86 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  30.23 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  29.86 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  29.86 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  37.5 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  30.23 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  29.17 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>