73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3511 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  730    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  58.59 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  44.72 
 
 		 379 aa  232  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  28.4 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  47.29 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  27.27 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  26.62 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  35.29 
 
 		 691 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  27.84 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  34.62 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  28.29 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  35.24 
 
 		 609 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  26.16 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1312  hypothetical protein  40.8 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  28.65 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  24.66 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  30.47 
 
 		 650 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  29.63 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  22.58 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  29.63 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  22.12 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  22.58 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  31.87 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  26.34 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  30.61 
 
 		 600 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.24 
 
 		 746 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  31.21 
 
 		 358 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  25.11 
 
 		 367 aa  53.1  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  26.06 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  31.93 
 
 		 758 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.93 
 
 		 763 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  28.86 
 
 		 740 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  31.93 
 
 		 763 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  31.93 
 
 		 763 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.37 
 
 		 730 aa  50.4  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  31.93 
 
 		 758 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  31.93 
 
 		 758 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  31.93 
 
 		 758 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  31.93 
 
 		 758 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  31.93 
 
 		 758 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  31.93 
 
 		 758 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  31.93 
 
 		 758 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.51 
 
 		 708 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.44 
 
 		 738 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3567  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  35.21 
 
 		 746 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  37.98 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.25 
 
 		 851 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.44 
 
 		 738 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  30.25 
 
 		 883 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  24.41 
 
 		 733 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.06 
 
 		 764 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1365  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  32.45 
 
 		 744 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.06 
 
 		 763 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.06 
 
 		 764 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.06 
 
 		 764 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  30.99 
 
 		 721 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.46 
 
 		 806 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  26.45 
 
 		 638 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  28 
 
 		 631 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  28.93 
 
 		 659 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  31.2 
 
 		 651 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.2 
 
 		 651 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  29.5 
 
 		 712 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.24 
 
 		 719 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1143  hypothetical protein  33.33 
 
 		 352 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1207  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.06 
 
 		 688 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00411304  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  24.79 
 
 		 372 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  27.98 
 
 		 712 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  29.5 
 
 		 712 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  31.18 
 
 		 724 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  26.7 
 
 		 638 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  29.14 
 
 		 638 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.121215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>