More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3275 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 		 559 aa  1139    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  54.64 
 
 		 561 aa  600  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  54.17 
 
 		 564 aa  594  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  53.01 
 
 		 548 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  53.14 
 
 		 557 aa  576  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  52.09 
 
 		 570 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  53.54 
 
 		 550 aa  571  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  52.82 
 
 		 549 aa  568  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  53.73 
 
 		 566 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  53.97 
 
 		 572 aa  568  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  51.62 
 
 		 555 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  51.73 
 
 		 552 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  52.54 
 
 		 582 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  53.82 
 
 		 574 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  54.96 
 
 		 553 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  54.81 
 
 		 559 aa  554  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  52.33 
 
 		 559 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  55.37 
 
 		 567 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  51.36 
 
 		 568 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  53.51 
 
 		 556 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  52.08 
 
 		 565 aa  551  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  51.72 
 
 		 564 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  51.9 
 
 		 565 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  51.27 
 
 		 559 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  54.83 
 
 		 567 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  53.64 
 
 		 572 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  54.83 
 
 		 567 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  49.82 
 
 		 558 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  54.64 
 
 		 567 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  54.28 
 
 		 567 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  54.46 
 
 		 567 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  51.01 
 
 		 552 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  53.42 
 
 		 567 aa  538  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  54.1 
 
 		 567 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  53.71 
 
 		 567 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  53.71 
 
 		 567 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  53.71 
 
 		 567 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  53.1 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  53.71 
 
 		 567 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  53.71 
 
 		 567 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  53.71 
 
 		 567 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  50.81 
 
 		 559 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  50.09 
 
 		 575 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  49.82 
 
 		 575 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  50.73 
 
 		 552 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  53.02 
 
 		 558 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  47.67 
 
 		 556 aa  522  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50.98 
 
 		 572 aa  525  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  50.8 
 
 		 581 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  50.18 
 
 		 576 aa  510  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  50.72 
 
 		 567 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  50.54 
 
 		 567 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  48.21 
 
 		 567 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  47.48 
 
 		 568 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  50.27 
 
 		 558 aa  489  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  50.72 
 
 		 566 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  47.22 
 
 		 538 aa  491  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  47.06 
 
 		 570 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 580 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  50.36 
 
 		 561 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  48.47 
 
 		 564 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  48.08 
 
 		 572 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  45.95 
 
 		 567 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  41.85 
 
 		 552 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  38.69 
 
 		 551 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.36 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  40.53 
 
 		 551 aa  358  1.9999999999999998e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  40 
 
 		 583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  37.92 
 
 		 561 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  39.45 
 
 		 543 aa  342  7e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  38.25 
 
 		 560 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.64 
 
 		 543 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  34.95 
 
 		 586 aa  290  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  34.35 
 
 		 587 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.32 
 
 		 569 aa  267  4e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.52 
 
 		 548 aa  267  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.13 
 
 		 569 aa  264  2e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.54 
 
 		 574 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.66 
 
 		 612 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.57 
 
 		 572 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.403033  normal  0.363537 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  31.24 
 
 		 566 aa  260  4e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.03 
 
 		 548 aa  261  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.76 
 
 		 588 aa  260  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05521  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.33 
 
 		 587 aa  260  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.49 
 
 		 618 aa  259  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.85 
 
 		 632 aa  258  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.18 
 
 		 586 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2091  acetolactate synthase large subunit  28.7 
 
 		 589 aa  257  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2128  acetolactate synthase large subunit  28.7 
 
 		 589 aa  257  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  31.01 
 
 		 638 aa  256  8e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.94 
 
 		 581 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.55 
 
 		 620 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0526  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.59 
 
 		 587 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.38 
 
 		 548 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.61 
 
 		 620 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.38 
 
 		 548 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.77 
 
 		 619 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6128  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.47 
 
 		 579 aa  253  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  31.04 
 
 		 623 aa  253  9.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.2 
 
 		 548 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>