91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3267 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3267  amidohydrolase 2  100 
 
 		 329 aa  681    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000314139 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3277  amidohydrolase 2  56.74 
 
 		 293 aa  330  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000257981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  39.01 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1021  hypothetical protein  30.93 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5784  amidohydrolase 2  29.93 
 
 		 283 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3770  amidohydrolase 2  27.07 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115169  normal  0.264283 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43770  predicted protein  26.85 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.02958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  31.76 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  27.33 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  24.71 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  26.78 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  24.65 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  29.77 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  29.64 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  29.3 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  29.3 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  29.3 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  30.26 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  29.3 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  29.92 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  27.57 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  29.3 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  25.35 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  24.81 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3877  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  26.76 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  26.9 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  26.9 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  25.1 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  27.34 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  25.88 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 276 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 275 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 275 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  23.55 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  27.21 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  29.25 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  27.73 
 
 		 290 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  31.36 
 
 		 277 aa  52.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5782  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 265 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.38 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  27.55 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  28.31 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  27.95 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  24.53 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  21.76 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  28.97 
 
 		 295 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  21.53 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  24.28 
 
 		 279 aa  49.7  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  28.57 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 281 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  28.57 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  23.62 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  28.57 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  28.57 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  28.57 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  29.6 
 
 		 272 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  20.74 
 
 		 285 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  24.83 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  24.5 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  26 
 
 		 278 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  29.31 
 
 		 272 aa  45.8  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  23.31 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  26.13 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  24.33 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  28.85 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43937  predicted protein  24 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00956853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  24.41 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  22.73 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  23.19 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  32.93 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  26.27 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  25.2 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  26.23 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4793  amidohydrolase 2  29.86 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1447  hypothetical protein  26.28 
 
 		 256 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0537  hypothetical protein  24.29 
 
 		 256 aa  42.7  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0233364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  23.57 
 
 		 280 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>