92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3266 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3266  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  697    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000301763 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4353  hypothetical protein  25.54 
 
 		 341 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0875589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2061  hypothetical protein  23.15 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  24.7 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3578  hypothetical protein  26.49 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0579989 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5286  hypothetical protein  23.93 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  25.16 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2301  hypothetical protein  23.24 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.100288  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2312  hypothetical protein  27.7 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  22.78 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  22.26 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  24.84 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0596  hypothetical protein  22.92 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.096367  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  28.32 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  26.39 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  23.96 
 
 		 324 aa  53.1  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  24 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0164  hypothetical protein  25.84 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  26.2 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  23.29 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  23.79 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1059  hypothetical protein  23.48 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0448256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  23.34 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  23.26 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  24.39 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  24.13 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2931  hypothetical protein  24.33 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  25.88 
 
 		 329 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2399  hypothetical protein  23.33 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  23.59 
 
 		 420 aa  49.7  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  22.71 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  22.19 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  23.95 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5175  hypothetical protein  24.41 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573585  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  26.51 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3173  hypothetical protein  24.92 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  22.19 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  25.69 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  24.57 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  23.1 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2390  hypothetical protein  23.63 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  21.63 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  21.84 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0670  hypothetical protein  23.53 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  23.9 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  21.88 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  22.56 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  22.01 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1073  hypothetical protein  23.08 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  24.04 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2501  hypothetical protein  25.19 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2488  hypothetical protein  31.21 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.572284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  22.55 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4524  hypothetical protein  24.32 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.650417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  25.28 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  21.68 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  25.49 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  24.52 
 
 		 326 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1641  hypothetical protein  23.76 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  26.52 
 
 		 383 aa  46.2  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2378  hypothetical protein  23.78 
 
 		 327 aa  46.2  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2972  hypothetical protein  22.73 
 
 		 323 aa  46.2  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  30.43 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  23.57 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  24.41 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  35.8 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2376  hypothetical protein  22.41 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  22.36 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  24.28 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3141  hypothetical protein  30.5 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1911  hypothetical protein  25.83 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0489557  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0436  hypothetical protein  22.89 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3510  hypothetical protein  21.6 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  23.62 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  21.74 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  20.99 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3851  hypothetical protein  25.15 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2443  hypothetical protein  20.95 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.241679 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3213  hypothetical protein  24.14 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  31.78 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3221  hypothetical protein  24.57 
 
 		 317 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  22.22 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5248  extra-cytoplasmic solute receptor  35.4 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821441  normal  0.224057 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3566  hypothetical protein  23.92 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00357296  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  23 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  22.89 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  24.26 
 
 		 332 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  26.33 
 
 		 333 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  23.95 
 
 		 322 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4630  extra-cytoplasmic solute receptor  35.51 
 
 		 353 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4195  hypothetical protein  23.75 
 
 		 331 aa  42.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  23.12 
 
 		 323 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>