More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3194 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  100 
 
 		 334 aa  654    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  91.32 
 
 		 334 aa  598  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  83.78 
 
 		 332 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  82.92 
 
 		 343 aa  530  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  84.44 
 
 		 342 aa  529  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  83.12 
 
 		 326 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  81.74 
 
 		 332 aa  515  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  79.88 
 
 		 328 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  82.22 
 
 		 327 aa  511  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  83.82 
 
 		 327 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  83.82 
 
 		 327 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  82.22 
 
 		 327 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  82.86 
 
 		 327 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  82.54 
 
 		 327 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  81.67 
 
 		 327 aa  508  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  78.38 
 
 		 329 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  79.31 
 
 		 328 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  79.11 
 
 		 322 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  84.28 
 
 		 321 aa  500  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  81.73 
 
 		 322 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  80.59 
 
 		 326 aa  484  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  78.57 
 
 		 327 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  78.76 
 
 		 326 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  79.28 
 
 		 328 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  79.12 
 
 		 305 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  77.52 
 
 		 322 aa  471  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  79.74 
 
 		 329 aa  464  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  74.21 
 
 		 334 aa  458  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  77.81 
 
 		 327 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  79.87 
 
 		 327 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  74.29 
 
 		 327 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  68.3 
 
 		 325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  68.3 
 
 		 323 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.25 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.9 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57.78 
 
 		 353 aa  344  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.17 
 
 		 344 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  60.58 
 
 		 349 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  60.13 
 
 		 343 aa  342  7e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.13 
 
 		 350 aa  342  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.52 
 
 		 350 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.84 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  59.81 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  59.94 
 
 		 354 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  60.39 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  59.87 
 
 		 358 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.49 
 
 		 345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  59.87 
 
 		 356 aa  339  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.94 
 
 		 356 aa  338  7e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  60.19 
 
 		 344 aa  338  8e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  59.29 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.42 
 
 		 351 aa  335  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  58.6 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  51.23 
 
 		 320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  52.48 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  49.19 
 
 		 325 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  46.86 
 
 		 323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  48.26 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  47.37 
 
 		 321 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  46.54 
 
 		 323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.79 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.33 
 
 		 310 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.84 
 
 		 329 aa  250  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  48.63 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  46.25 
 
 		 320 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  45.75 
 
 		 366 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  46.25 
 
 		 320 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  41.16 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  48.51 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.03 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.03 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  44.26 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  40 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  44.7 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.82 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  41.9 
 
 		 321 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.88 
 
 		 346 aa  207  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  39.72 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  37.42 
 
 		 455 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  36.75 
 
 		 455 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  33.64 
 
 		 473 aa  162  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  37.09 
 
 		 442 aa  162  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  38 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  36.75 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  36.75 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  36.75 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  36.75 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  33.64 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  36.93 
 
 		 450 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  35.41 
 
 		 572 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  34.88 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  33.54 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  36.69 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  34.94 
 
 		 482 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34.77 
 
 		 444 aa  159  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  35.49 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  34.54 
 
 		 569 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.71 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  34.94 
 
 		 480 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  37.69 
 
 		 438 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>