More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3114 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3114  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  678    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0319  protein of unknown function DUF21  58.24 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000713194  normal  0.0140808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2794  protein of unknown function DUF21  51.63 
 
 		 340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2950  protein of unknown function DUF21  51.04 
 
 		 341 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0446  protein of unknown function DUF21  49.11 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3860  protein of unknown function DUF21  48.41 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00358184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  47.89 
 
 		 333 aa  278  7e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1686  CBS  45.24 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0016  protein of unknown function DUF21  47.6 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.430522  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  46.56 
 
 		 336 aa  265  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2682  hypothetical protein  47.92 
 
 		 332 aa  259  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3861  hypothetical protein  48.81 
 
 		 332 aa  255  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3478  hypothetical protein  46.13 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3541  hypothetical protein  46.13 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3491  hypothetical protein  46.13 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  39.51 
 
 		 344 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  37.88 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  36.67 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  37 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  37.8 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 		 358 aa  160  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  36.2 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  37.58 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  35.1 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  33.23 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  33.23 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  33.23 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  32.53 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  32.94 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  32.93 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 351 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  32.13 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  33.13 
 
 		 348 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  33.53 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  32.34 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  32.15 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  33.23 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  32.61 
 
 		 346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  30.81 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  30.03 
 
 		 443 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  31.04 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  31.16 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  30.84 
 
 		 357 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  26.63 
 
 		 446 aa  123  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 		 346 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  31 
 
 		 574 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  31.43 
 
 		 376 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  31.99 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48540  hypothetical protein  27.49 
 
 		 463 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0608303  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  31.15 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  32.02 
 
 		 441 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  28.61 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  30.56 
 
 		 520 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  31.89 
 
 		 469 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  31.27 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  28.13 
 
 		 437 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  27.56 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  28.37 
 
 		 439 aa  113  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  24.86 
 
 		 435 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  31.71 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  25 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  25 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  25 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  25 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  28.07 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  31.12 
 
 		 452 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6141  hypothetical protein  27.16 
 
 		 446 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  32.92 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70770  hypothetical protein  27.16 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.883998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  24.86 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  24.57 
 
 		 435 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  24.57 
 
 		 435 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  28.31 
 
 		 356 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  29.09 
 
 		 356 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  29 
 
 		 433 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  26.01 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0662  hypothetical protein  25.52 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  27.78 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  38.54 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  27.86 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  26.25 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  27.41 
 
 		 446 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  31.46 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  24.71 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  26.54 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  25.6 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5369  hypothetical protein  25.38 
 
 		 446 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.086595  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  25.98 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 		 438 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  25.98 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  29.45 
 
 		 444 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  25.22 
 
 		 446 aa  106  6e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5230  hypothetical protein  25.38 
 
 		 446 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  25.98 
 
 		 432 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  25.98 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  25.98 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0152  hypothetical protein  25.15 
 
 		 446 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>