More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3056 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3056  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  48.07 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0008  ABC transporter related  48.93 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419449  hitchhiker  0.000235622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  48.07 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  44.64 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  47.01 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.16 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  42.49 
 
 		 234 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  43.1 
 
 		 236 aa  201  6e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  43.35 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  44.83 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  43.64 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  40.34 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  45.92 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  40.34 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  45.53 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.29 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  44.83 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  43.1 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1498  ABC transporter related  41.63 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  42.92 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  43.1 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0899  ABC transporter related  44.64 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  43.97 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  43.22 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  40.34 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  43.59 
 
 		 238 aa  192  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1826  ABC transporter related  43.35 
 
 		 231 aa  191  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1710  ABC transporter related  45.06 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  40.34 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  45.74 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  45.11 
 
 		 246 aa  189  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  43.37 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3332  ABC transporter related  40.6 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  45.92 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  44.17 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  43.1 
 
 		 237 aa  188  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  42.06 
 
 		 234 aa  188  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2585  ABC transporter related  43.44 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 236 aa  187  8e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  39.66 
 
 		 237 aa  188  8e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  45.73 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  44.4 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23010  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  45.15 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  43.83 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  42.8 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.4 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.7 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  41.85 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  42.8 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  40.95 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  42.37 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  39.13 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  41.45 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  46.22 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  39.41 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  45.06 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  42.86 
 
 		 256 aa  185  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  42.67 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  43.35 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  42.67 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0145  ABC transporter related  45.83 
 
 		 243 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  42.5 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  45.06 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  41.81 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  40.95 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  41.81 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  42.92 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  44.3 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  42.29 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  40.34 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  44.3 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  41.81 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  45.49 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  43.95 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1600  ABC transporter related  42.06 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.94084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  42.06 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  44.35 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  43.18 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  42.37 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  44.3 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  38.79 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  43.4 
 
 		 270 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  42.31 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  42.67 
 
 		 233 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  42.92 
 
 		 694 aa  182  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3498  ABC transporter related  42.62 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.04 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>