26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2947 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2947  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  895    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00388563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2236  hypothetical protein  58.02 
 
 		 365 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.223235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2260  hypothetical protein  56.88 
 
 		 365 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0934  hypothetical protein  56.88 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666525  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1818  hypothetical protein  50.9 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0390612  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2795  hypothetical protein  53.02 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47046  normal  0.835559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2672  hypothetical protein  47.45 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00279858  normal  0.129736 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1382  hypothetical protein  41.97 
 
 		 370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0765  hypothetical protein  38.67 
 
 		 373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2819  hypothetical protein  40.27 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.713982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4150  hypothetical protein  38.54 
 
 		 381 aa  252  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2000  hypothetical protein  35.87 
 
 		 395 aa  226  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1286  hypothetical protein  31.54 
 
 		 390 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3673  hypothetical protein  27.76 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00019433  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2447  hypothetical protein  28.27 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3076  YdjG  26.43 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00334789  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1482  hypothetical protein  24.57 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0757652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0400  hypothetical protein  23.71 
 
 		 342 aa  123  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0606591  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2484  hypothetical protein  27.11 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3172  hypothetical protein  24.69 
 
 		 354 aa  111  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2107  hypothetical protein  24.11 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.111621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0870  hypothetical protein  23.58 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.774853 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1614  hypothetical protein  21.2 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06430  hypothetical protein  22.89 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1032  hypothetical protein  22.41 
 
 		 404 aa  44.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.435102  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2818  hypothetical protein  22.97 
 
 		 324 aa  43.5  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.425711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>