153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2921 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  100 
 
 
247 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  32.67 
 
 
263 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2187  biotin biosynthesis protein BioC  34.02 
 
 
268 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  28.97 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  28.63 
 
 
260 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  30.47 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  35.52 
 
 
474 aa  89.7  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  32.02 
 
 
255 aa  85.5  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1385  biotin synthesis protein BioC  23.75 
 
 
233 aa  82.4  7e-15  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  31.25 
 
 
261 aa  81.3  1e-14  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  27.49 
 
 
255 aa  81.3  1e-14  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0084  putative biotin synthesis protein  23.5 
 
 
229 aa  79.7  4e-14  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1661  biotin biosynthesis protein BioC  26.51 
 
 
228 aa  74.7  1e-12  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0081  biotin biosynthesis protein BioC  30 
 
 
261 aa  74.3  2e-12  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  26.03 
 
 
250 aa  71.2  1e-11  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  23.98 
 
 
269 aa  68.2  1e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  23.98 
 
 
269 aa  67.8  2e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  23.58 
 
 
269 aa  66.6  3e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  23.58 
 
 
269 aa  66.6  3e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  23.58 
 
 
269 aa  66.6  3e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  23.58 
 
 
269 aa  66.6  3e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  23.58 
 
 
269 aa  66.6  3e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  24.11 
 
 
269 aa  65.9  6e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  30.68 
 
 
270 aa  65.9  6e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  24.41 
 
 
269 aa  65.5  8e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  24.44 
 
 
283 aa  65.1  9e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  24.81 
 
 
270 aa  65.1  9e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  35.04 
 
 
267 aa  65.1  9e-10  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2455  methyltransferase type 11  25.77 
 
 
279 aa  65.1  1e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.527849  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  27.99 
 
 
267 aa  64.7  1e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  35.04 
 
 
267 aa  65.1  1e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 
267 aa  64.7  1e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0326  biotin biosynthesis protein BioC  24.06 
 
 
228 aa  64.3  2e-09  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  35.04 
 
 
267 aa  64.3  2e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  22.96 
 
 
269 aa  63.5  3e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  26.16 
 
 
273 aa  63.2  4e-09  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0349  biotin biosynthesis protein BioC  23.58 
 
 
228 aa  63.2  4e-09  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  21.89 
 
 
279 aa  61.6  1e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  32.03 
 
 
291 aa  61.2  1e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  27.66 
 
 
292 aa  61.2  2e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  8.94072e-06 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2131  biotin synthesis protein  25.1 
 
 
274 aa  60.8  2e-08  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.239088  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  27.66 
 
 
292 aa  61.2  2e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 
252 aa  60.1  3e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  28.38 
 
 
291 aa  60.5  3e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  29.25 
 
 
275 aa  59.7  4e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  25.43 
 
 
307 aa  59.3  5e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.08 
 
 
269 aa  59.3  6e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  33.72 
 
 
251 aa  58.9  7e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  25.35 
 
 
247 aa  58.9  7e-08  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  25.35 
 
 
248 aa  58.9  8e-08  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  33.56 
 
 
267 aa  58.5  9e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  23.7 
 
 
315 aa  58.5  9e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  22.22 
 
 
285 aa  58.5  1e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  33.14 
 
 
251 aa  58.5  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  29.27 
 
 
253 aa  58.5  1e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  33.72 
 
 
251 aa  57.4  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  30.73 
 
 
251 aa  57.8  2e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  32.94 
 
 
251 aa  57.8  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2062  putative methyl transferase  19.57 
 
 
230 aa  56.6  3e-07  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00567331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  28.9 
 
 
269 aa  56.6  3e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  25.3 
 
 
266 aa  57  3e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  33.14 
 
 
251 aa  56.6  4e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.89171e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  29.81 
 
 
267 aa  55.8  6e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  32.21 
 
 
272 aa  55.8  7e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  28.46 
 
 
262 aa  55.1  1e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  28.69 
 
 
253 aa  55.1  1e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  6.3017e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  24.44 
 
 
268 aa  54.3  2e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  33.82 
 
 
268 aa  54.3  2e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  29.2 
 
 
290 aa  54.7  2e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3874  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
262 aa  54.3  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  26.34 
 
 
253 aa  53.9  2e-06  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  31.09 
 
 
251 aa  53.5  3e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.19753e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  30.61 
 
 
251 aa  53.5  3e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.10618e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  28.1 
 
 
269 aa  53.9  3e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  33.55 
 
 
251 aa  53.1  4e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.58566e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  31.05 
 
 
274 aa  53.1  4e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  32.81 
 
 
249 aa  52.4  7e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
249 aa  52  8e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  33.33 
 
 
249 aa  52  8e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  32.89 
 
 
251 aa  51.2  1e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.03036e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  33.6 
 
 
249 aa  52  1e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  24.44 
 
 
309 aa  51.6  1e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  30.92 
 
 
291 aa  51.2  1e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  32.89 
 
 
251 aa  50.8  2e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.76262e-06  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  30.14 
 
 
260 aa  50.8  2e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  32.89 
 
 
251 aa  50.8  2e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  8.73779e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  29.77 
 
 
294 aa  50.8  2e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3790  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
262 aa  50.8  2e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  32.89 
 
 
251 aa  50.8  2e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.34794e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  32.89 
 
 
251 aa  50.8  2e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  7.40427e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  34.27 
 
 
256 aa  50.8  2e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  32.89 
 
 
251 aa  50.8  2e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.07707e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  30.18 
 
 
249 aa  50.1  3e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  28.73 
 
 
246 aa  50.1  3e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 
216 aa  50.1  3e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  32.37 
 
 
272 aa  50.1  3e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
264 aa  49.7  4e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
267 aa  50.1  4e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  24.2 
 
 
268 aa  49.3  5e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  28.49 
 
 
309 aa  49.7  5e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>