88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2899 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 
185 aa  359  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  58.24 
 
 
183 aa  195  2e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  67.3 
 
 
205 aa  194  5e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  69.44 
 
 
187 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  68.75 
 
 
187 aa  189  3e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  63.76 
 
 
190 aa  184  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  61.82 
 
 
187 aa  183  1e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  57.14 
 
 
215 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  55.4 
 
 
248 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  58.78 
 
 
159 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  52.26 
 
 
222 aa  148  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  52.26 
 
 
222 aa  148  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  53.24 
 
 
215 aa  147  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  52.6 
 
 
177 aa  147  1e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  52.6 
 
 
177 aa  146  2e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  53.19 
 
 
240 aa  145  4e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  54.55 
 
 
144 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  51.01 
 
 
220 aa  144  7e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  54.89 
 
 
235 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  59.23 
 
 
156 aa  140  1e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  59.23 
 
 
156 aa  140  1e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  54.81 
 
 
219 aa  138  4e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  59.23 
 
 
157 aa  137  9e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  47.65 
 
 
174 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  51.01 
 
 
184 aa  134  6e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  1.00699e-05 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  44.97 
 
 
189 aa  133  2e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  41.86 
 
 
240 aa  128  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  47.1 
 
 
371 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  57.25 
 
 
139 aa  124  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  42.94 
 
 
231 aa  122  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  34.81 
 
 
177 aa  117  8e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  47.22 
 
 
216 aa  116  2e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50589e-08 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  38.56 
 
 
177 aa  116  2e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  46.53 
 
 
216 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  34.81 
 
 
177 aa  112  4e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  42.24 
 
 
176 aa  111  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  40.99 
 
 
183 aa  110  1e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  43.12 
 
 
228 aa  109  2e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  45.99 
 
 
244 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  39.34 
 
 
233 aa  101  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  38.65 
 
 
228 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  43.61 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  42.14 
 
 
243 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  40.46 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  37.35 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  34.16 
 
 
165 aa  90.9  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  46.32 
 
 
149 aa  89.4  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  44.7 
 
 
150 aa  89.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  39.6 
 
 
248 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  41.4 
 
 
168 aa  87.8  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  37.24 
 
 
213 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  36.36 
 
 
233 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  5.25183e-05 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  38.51 
 
 
236 aa  82  5e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  4.23537e-09 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  38.22 
 
 
171 aa  81.6  6e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  38.1 
 
 
250 aa  80.9  9e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  35.77 
 
 
167 aa  79  4e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  34.31 
 
 
165 aa  77.4  1e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  34.31 
 
 
165 aa  77.4  1e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  34.06 
 
 
180 aa  67.4  1e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  32.12 
 
 
198 aa  62.4  3e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  33.78 
 
 
579 aa  59.7  2e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  26.95 
 
 
248 aa  57.4  1e-07  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  27.45 
 
 
201 aa  54.7  8e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  32.24 
 
 
177 aa  54.3  1e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  37.72 
 
 
646 aa  52.8  3e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  23.03 
 
 
562 aa  49.7  2e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.33544e-10 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  32.28 
 
 
177 aa  49.3  3e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  28.48 
 
 
220 aa  48.5  5e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  29.75 
 
 
194 aa  48.5  5e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  28.48 
 
 
220 aa  48.5  5e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4383  prohead protease  26.57 
 
 
239 aa  48.1  6e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  29.17 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  32.77 
 
 
645 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  2.04536e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  32.77 
 
 
645 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.01798e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  32.77 
 
 
645 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  29.17 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5359  prophage LambdaBa03, prohead protease  28.3 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4980  prophage LambdaBa03, prohead protease  28.3 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  26.67 
 
 
186 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  34.58 
 
 
659 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  31.9 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  34.26 
 
 
612 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  38.71 
 
 
600 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  27.52 
 
 
169 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  31.78 
 
 
659 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  31.58 
 
 
526 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  31.58 
 
 
526 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  31.58 
 
 
526 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>