More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2805 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2805  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.89 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  41.41 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  37.97 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.31 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  36.11 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 		 217 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  30.37 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.73 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  36.82 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  30.19 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.71 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.87 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.69 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.81 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.29 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  38.81 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  35.68 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  36.95 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.89 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.32 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.24 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  38.16 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  33.14 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3172  lysine exporter protein LysE/YggA  40.59 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  34.48 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  34.48 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.19 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  34.48 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.85 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  34.48 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  35.08 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.99 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.79 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  35.23 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  34.46 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  35.09 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.48 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.16 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0187  amino-acid exporter protein  38.07 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 227 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  33.83 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.59 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  33.83 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.78 
 
 		 232 aa  93.2  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  33.83 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  33.83 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  35.09 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  36.18 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.69 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  32.84 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  39.74 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4170  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.24 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319888  normal  0.802735 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.7 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  35.33 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  32 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  35.62 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  33.91 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1052  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 		 218 aa  91.7  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  32.11 
 
 		 205 aa  91.3  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  35.37 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.48 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  37.74 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.14 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.99 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  34.17 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  31.45 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  34.34 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>