More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2797 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  922    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  40.88 
 
 
529 aa  273  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  40.51 
 
 
514 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  38.8 
 
 
549 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  38.6 
 
 
540 aa  269  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  39.76 
 
 
529 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  39.01 
 
 
562 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  39.05 
 
 
542 aa  260  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  46.83 
 
 
332 aa  256  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  38.51 
 
 
505 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  39.36 
 
 
506 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  38.31 
 
 
505 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  39 
 
 
507 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  38 
 
 
523 aa  244  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  37.94 
 
 
506 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  37.61 
 
 
503 aa  240  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  37.76 
 
 
504 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  51.27 
 
 
328 aa  236  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  37.42 
 
 
509 aa  236  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  37.5 
 
 
507 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  36.93 
 
 
505 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  33.47 
 
 
497 aa  229  8e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  35.48 
 
 
513 aa  223  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  35.27 
 
 
513 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  35.68 
 
 
509 aa  216  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  45.57 
 
 
323 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  44.44 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  35.58 
 
 
502 aa  213  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  38.81 
 
 
498 aa  213  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  35.67 
 
 
523 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  40.43 
 
 
332 aa  193  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  42.63 
 
 
360 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  47.62 
 
 
341 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  45.15 
 
 
342 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  47.15 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  41.4 
 
 
358 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  41.69 
 
 
328 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  39.43 
 
 
362 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  38.18 
 
 
365 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  37.18 
 
 
363 aa  146  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  37.9 
 
 
308 aa  143  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  55.84 
 
 
169 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  57.75 
 
 
161 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 
372 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  36.01 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  32.5 
 
 
344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  36.21 
 
 
323 aa  127  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  51.01 
 
 
158 aa  127  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  34.43 
 
 
330 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  35.27 
 
 
387 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  35.27 
 
 
387 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  51.92 
 
 
161 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  32.32 
 
 
333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  31.75 
 
 
341 aa  120  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  32.36 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  30.38 
 
 
384 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
427 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  31.89 
 
 
379 aa  117  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  32.69 
 
 
350 aa  117  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  31.77 
 
 
338 aa  117  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  33.33 
 
 
365 aa  116  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  32.77 
 
 
346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  32.67 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  32.37 
 
 
325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  62.77 
 
 
176 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  36.59 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  32.49 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  31.43 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  31.43 
 
 
356 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  32.4 
 
 
338 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  33.97 
 
 
341 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  34.95 
 
 
352 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  31.1 
 
 
341 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  46.71 
 
 
165 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  26.39 
 
 
312 aa  109  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
340 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  33.88 
 
 
340 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  31.99 
 
 
339 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  30.23 
 
 
379 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  29.38 
 
 
345 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  32.75 
 
 
341 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  30.9 
 
 
349 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  31.74 
 
 
349 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  29.45 
 
 
391 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  28.8 
 
 
334 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 
336 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0916  aminoglycoside phosphotransferase  35.5 
 
 
344 aa  106  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.318568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  31.78 
 
 
338 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  31.65 
 
 
348 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 
349 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 
349 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 
349 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  32.69 
 
 
344 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  30.56 
 
 
401 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  31.61 
 
 
348 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  33.97 
 
 
357 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  46.81 
 
 
150 aa  103  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  33.09 
 
 
339 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  31.63 
 
 
349 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  31.9 
 
 
339 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>