270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2732 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  594  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  75.9 
 
 
306 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  75.57 
 
 
306 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  72.04 
 
 
306 aa  414  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  75.57 
 
 
306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  69.08 
 
 
307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  68.32 
 
 
330 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  62.42 
 
 
305 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  57.05 
 
 
307 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  56.39 
 
 
307 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  58.82 
 
 
310 aa  328  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  57.81 
 
 
308 aa  322  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  57.62 
 
 
307 aa  318  7.999999999999999e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  60.6 
 
 
306 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  61.33 
 
 
316 aa  316  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  61 
 
 
316 aa  316  4e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  56.25 
 
 
307 aa  312  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  52.67 
 
 
315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  52.63 
 
 
304 aa  296  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  61.59 
 
 
307 aa  295  6e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  50.5 
 
 
308 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  49.5 
 
 
343 aa  279  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  52.65 
 
 
304 aa  276  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  50.33 
 
 
308 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  49.5 
 
 
307 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  48.84 
 
 
307 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  47.51 
 
 
320 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  47.35 
 
 
305 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  51.82 
 
 
307 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  49.01 
 
 
307 aa  245  9e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  49.51 
 
 
312 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  47.44 
 
 
296 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  52.48 
 
 
307 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  48.32 
 
 
303 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  49.34 
 
 
308 aa  227  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  47.33 
 
 
301 aa  191  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  36.36 
 
 
313 aa  177  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  30.8 
 
 
394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 
350 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  30.22 
 
 
426 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 
346 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  30.82 
 
 
352 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  28.46 
 
 
356 aa  99.4  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  28.53 
 
 
349 aa  99.4  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  29.92 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  28.81 
 
 
356 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  30.18 
 
 
346 aa  95.9  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  30.36 
 
 
339 aa  95.5  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  30.29 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  28.36 
 
 
443 aa  92.8  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  28.46 
 
 
350 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  30 
 
 
361 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  29.89 
 
 
428 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  28.87 
 
 
427 aa  89.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  28.15 
 
 
415 aa  89.4  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  28.4 
 
 
354 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  27.46 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  32.3 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  29.18 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  26.92 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  32 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  28.35 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.26 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.44 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  28.17 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  27.88 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  25.93 
 
 
257 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  29.62 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  24.63 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  26.76 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  26.43 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  30.34 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  28.78 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  26.48 
 
 
254 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  28.52 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  28.52 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  28.52 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  28.52 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  24.24 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  28.83 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  28.14 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  28.63 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  31.43 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  28.14 
 
 
262 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  28.63 
 
 
266 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  32.09 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  27.2 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  24.03 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  26.52 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  24.82 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  26.16 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  24.26 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  24.26 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  21.92 
 
 
261 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  23.08 
 
 
261 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  26.45 
 
 
354 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  21.92 
 
 
261 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  27.21 
 
 
253 aa  62.8  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  28.67 
 
 
269 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>