More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2717 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 227 aa  453  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0359  lipoprotein signal peptidase  56.58 
 
 		 158 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1099  lipoprotein signal peptidase  53.59 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2929  lipoprotein signal peptidase  60.53 
 
 		 186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0877107  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2762  lipoprotein signal peptidase  54.65 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  53.79 
 
 		 160 aa  139  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4043  signal peptidase II  45.81 
 
 		 157 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 171 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 171 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 		 164 aa  91.7  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  37.31 
 
 		 171 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 154 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 171 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  32.34 
 
 		 199 aa  88.6  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 160 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  37.78 
 
 		 181 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 		 165 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 166 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 166 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 166 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 166 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 166 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 166 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 166 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 171 aa  86.3  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 166 aa  85.9  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 159 aa  85.5  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 166 aa  85.5  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  34.71 
 
 		 163 aa  85.1  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  34.71 
 
 		 165 aa  85.1  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 		 178 aa  84.7  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  40.74 
 
 		 165 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  35.04 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  33.73 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  37.95 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2206  lipoprotein signal peptidase  42.02 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.252335  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  39.68 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  32.98 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  30.99 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  35.16 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  33.71 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  36.22 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  35.12 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 		 178 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  37.27 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3258  signal peptidase II  40.52 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802617  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  36.22 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  36.22 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  28.85 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  30.95 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  31.95 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  33.96 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  30.72 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  33.94 
 
 		 166 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  32.05 
 
 		 162 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  30.56 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  33.94 
 
 		 166 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  35.07 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  32.1 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  42.18 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  36.14 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>