172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2692 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2692  hypothetical protein  100 
 
 
688 aa  1362    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3328  hypothetical protein  41.44 
 
 
694 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.901171  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1571  virulence factor MCE-like protein-related protein  34.91 
 
 
808 aa  331  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.645853  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  30.32 
 
 
559 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  29.42 
 
 
559 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  29.55 
 
 
558 aa  236  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  30.06 
 
 
537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  32.88 
 
 
537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1920  hypothetical protein  28.44 
 
 
554 aa  232  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.976156  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  29.67 
 
 
572 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  29.59 
 
 
539 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  32.49 
 
 
559 aa  227  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  29.06 
 
 
551 aa  226  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  29.21 
 
 
539 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1865  hypothetical protein  27.74 
 
 
554 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0867784 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  29.21 
 
 
539 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  29.15 
 
 
551 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  29.64 
 
 
556 aa  225  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2113  hypothetical protein  27.55 
 
 
554 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.696493  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  30.93 
 
 
555 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  31.42 
 
 
548 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  29.94 
 
 
531 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  29.16 
 
 
545 aa  218  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  30.32 
 
 
550 aa  217  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  30.32 
 
 
550 aa  217  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  30.32 
 
 
550 aa  217  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  28.04 
 
 
539 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  28.04 
 
 
539 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  28.04 
 
 
539 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  28.01 
 
 
551 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  27.25 
 
 
554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  29.48 
 
 
531 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  28.01 
 
 
551 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  30.56 
 
 
546 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  28.01 
 
 
539 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  31.41 
 
 
547 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  30.24 
 
 
546 aa  214  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  28.01 
 
 
551 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  28.01 
 
 
551 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  28.01 
 
 
551 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  28.01 
 
 
553 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  27.81 
 
 
551 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  28.43 
 
 
552 aa  213  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  30.4 
 
 
548 aa  213  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  27.42 
 
 
551 aa  213  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1746  paraquat-inducible protein B  28.72 
 
 
548 aa  213  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  decreased coverage  0.000000731619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  28.26 
 
 
552 aa  211  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  31.46 
 
 
546 aa  210  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  29.85 
 
 
546 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  29.35 
 
 
546 aa  209  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  29.66 
 
 
546 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  28.46 
 
 
552 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  29.58 
 
 
546 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  29.38 
 
 
546 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000764872  normal  0.254429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  29.38 
 
 
546 aa  208  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  29.38 
 
 
546 aa  208  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  29.05 
 
 
539 aa  208  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  29.38 
 
 
546 aa  208  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  29.38 
 
 
546 aa  208  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  29.89 
 
 
546 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  28.69 
 
 
550 aa  208  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  29.38 
 
 
546 aa  208  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  29.38 
 
 
546 aa  208  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2008  hypothetical protein  29.15 
 
 
547 aa  207  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  27.4 
 
 
544 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  30.08 
 
 
556 aa  207  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  29.65 
 
 
546 aa  207  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  29.65 
 
 
546 aa  207  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  29.65 
 
 
546 aa  207  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  29.65 
 
 
546 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  28.57 
 
 
548 aa  205  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  28.63 
 
 
539 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3077  putative paraquat-inducible protein B  26.39 
 
 
580 aa  204  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198785  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  29.86 
 
 
533 aa  203  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  28 
 
 
547 aa  203  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  28.21 
 
 
547 aa  203  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  30.56 
 
 
558 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  28.86 
 
 
531 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  30.33 
 
 
561 aa  201  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1463  paraquat-inducible protein B  29.35 
 
 
545 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0560595  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  27.88 
 
 
543 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02851  hypothetical protein  28.36 
 
 
548 aa  196  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  29.71 
 
 
555 aa  193  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  29.92 
 
 
546 aa  190  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  29.14 
 
 
508 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  28.93 
 
 
547 aa  187  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  29.01 
 
 
547 aa  187  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1352  paraquat-inducible protein B  25.81 
 
 
547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273869  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1570  hypothetical protein  27.95 
 
 
538 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2722  paraquat-inducible protein B  26.97 
 
 
550 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  28.24 
 
 
534 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  30.14 
 
 
569 aa  183  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003028  paraquat-inducible protein B  27.14 
 
 
548 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2391  hypothetical protein  30.47 
 
 
545 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931506  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  28.3 
 
 
547 aa  181  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02656  putative paraquat-inducible protein B  27.42 
 
 
555 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2932  hypothetical protein  26.48 
 
 
548 aa  170  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0281  PqiB family protein  29.07 
 
 
1035 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2606  PqiB family protein  31.77 
 
 
869 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2566  hypothetical protein  30.59 
 
 
879 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.830034  normal  0.124645 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>