130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2474 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2474  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  100 
 
 
277 aa  530  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2705  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  45.36 
 
 
286 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2647  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  42.91 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43955  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1118  hypothetical protein  43.42 
 
 
288 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.141712  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1023  hypothetical protein  43.42 
 
 
288 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2907  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  44.04 
 
 
294 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.610469  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0514  hypothetical protein  37.94 
 
 
295 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.313056  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0448  hypothetical protein  37.94 
 
 
295 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3545  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.28 
 
 
295 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00374918  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3407  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  40.39 
 
 
294 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1358  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  38.89 
 
 
300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4172  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  44.06 
 
 
293 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3151  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.14 
 
 
295 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000102812  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2984  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.4 
 
 
298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000332837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3827  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.27 
 
 
293 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.594818  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0143  hypothetical protein  31.36 
 
 
294 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3124  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.74 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.025848  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03429  hypothetical protein  32.98 
 
 
296 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002580  glucosamine kinase GpsK  36.89 
 
 
296 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0107  putative Aryl-alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
293 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135343  normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2870  hypothetical protein  37.87 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0087  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  37.87 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3445  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  37.87 
 
 
311 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1674  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  37.87 
 
 
311 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3947  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  37.87 
 
 
311 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3105  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  37.87 
 
 
311 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3192  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  37.64 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1653  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.34 
 
 
293 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0892044  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3866  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  37.5 
 
 
311 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3017  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  42.22 
 
 
302 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00939797  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0944  hypothetical protein  42.22 
 
 
301 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3348  BadF/BadG/BcrA/BcrD type ATPase  37.31 
 
 
293 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.95774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0159  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.17 
 
 
293 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4169  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.28 
 
 
295 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0976087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3114  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  41.67 
 
 
302 aa  105  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000171707  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2935  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  41.67 
 
 
302 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000122964  normal  0.641945 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1076  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  42.22 
 
 
318 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1212  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  41.27 
 
 
298 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000148671  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2582  glucosamine kinase  32.85 
 
 
291 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2861  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.31 
 
 
293 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0246  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.31 
 
 
293 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0155  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  38.2 
 
 
293 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0228  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.31 
 
 
293 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3507  hypothetical protein  41.67 
 
 
300 aa  102  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1116  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  40.45 
 
 
299 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0080309  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2706  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.3 
 
 
299 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00102346  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1144  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  40.31 
 
 
311 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000862311  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1084  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  40.31 
 
 
311 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1178  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  40.31 
 
 
311 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000024561  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3211  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  40.31 
 
 
311 aa  98.6  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000118856  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3036  hypothetical protein  31.84 
 
 
303 aa  97.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.364678  hitchhiker  0.000035288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1312  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  39.66 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000103615  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0172  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.55 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1026  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  36.11 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0709  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.25 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.87452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00859  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.16 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3136  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  38.74 
 
 
308 aa  93.2  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235099  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1101  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  39.23 
 
 
298 aa  92.8  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3528  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.23 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.02 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3677  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.72 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2501  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.46 
 
 
322 aa  86.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2421  hypothetical protein  31.7 
 
 
297 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0124  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.47 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0298  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.8 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2483  hypothetical protein  29.74 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2294  hypothetical protein  30.49 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2466  hypothetical protein  30.49 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34710  predicted N-acetylglucosamine kinase  35.32 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.11671  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2257  ATPase family protein  29.74 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.163668  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2007  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.02 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0254624  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.2 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1126  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.84 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2273  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.82 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27571  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1633  N-acetylglucosamine kinase  35.33 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.935257 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2562  hypothetical protein  30.04 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.516208  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1676  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.86 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2499  hypothetical protein  29.28 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4217  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.11 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0191296 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2466  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.43 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.796811 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1491  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.94 
 
 
319 aa  72  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1539  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.94 
 
 
319 aa  72  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2215  ATPase family protein  28.12 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1791  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.73 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.51133  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2752  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  35.78 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0391  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  35.62 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453168  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2852  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.63 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2909  hypothetical protein  28.23 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.464357 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0371  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.93 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3353  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.19 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1667  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.57 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0319  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.15 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414732  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1100  hypothetical protein  32.66 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.454532 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0292  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.7 
 
 
335 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.353366  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6680  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.11 
 
 
377 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1855  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.54 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.591681 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1926  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.5 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2794  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  35.29 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1852  N-acetylglucosamine kinase  26.05 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000190255  hitchhiker  0.000260194 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.34 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>