More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2452 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 463 aa  902    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  60.13 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  59.69 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  31.47 
 
 		 443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  34.85 
 
 		 440 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  35.43 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  34.85 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  34.85 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  34.85 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  34.85 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  34.85 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  34.85 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  34.92 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  33.9 
 
 		 449 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  29.62 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  33.69 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  33.57 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  32.97 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.68 
 
 		 494 aa  144  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  32.03 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  30.43 
 
 		 415 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  27 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  31.88 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  27.23 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.5 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  27.48 
 
 		 429 aa  127  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  30.65 
 
 		 460 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  30.91 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  28.89 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  31.1 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  31.34 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  31.03 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  29.54 
 
 		 432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  33.56 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  29.82 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  30.61 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  29.88 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  29.88 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  29.53 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  30.55 
 
 		 443 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  27.86 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  28.76 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  29.88 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  29.61 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  31.1 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  31.1 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  31.1 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  30.81 
 
 		 434 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  31.34 
 
 		 487 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.23 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  31.34 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  29.12 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  31.34 
 
 		 289 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  32.16 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  31.03 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  31.34 
 
 		 291 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  30.11 
 
 		 404 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  31.05 
 
 		 291 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  27.7 
 
 		 493 aa  95.5  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  30.42 
 
 		 278 aa  90.9  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  30.57 
 
 		 290 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  31.25 
 
 		 261 aa  87  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  45.54 
 
 		 426 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  45.54 
 
 		 421 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  45.54 
 
 		 421 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  45.54 
 
 		 421 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  44.64 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  44.64 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  44.64 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  35.53 
 
 		 257 aa  86.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  44.04 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  35.53 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  27.38 
 
 		 536 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  27.38 
 
 		 535 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  28.12 
 
 		 536 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  25.59 
 
 		 282 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  26.44 
 
 		 282 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.82 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4998  OmpA/MotB  43.86 
 
 		 119 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  42.15 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  26 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.1 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.18 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  27.98 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  28.37 
 
 		 241 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5862  OmpA/MotB domain-containing protein  45.37 
 
 		 103 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  29.77 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40.41 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  30.41 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  31.76 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  27.49 
 
 		 594 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  30.82 
 
 		 253 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  30.14 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  30.43 
 
 		 253 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  42.48 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  27.25 
 
 		 552 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  27.25 
 
 		 552 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>