74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2450 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  296  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3128  hypothetical protein  53.42 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0000351189  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3484  hypothetical protein  52.05 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.764969  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  38.21 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  34.48 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  36.75 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  33.62 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  32.8 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  30.08 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  37.62 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  42 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  33.11 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  28.47 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  28.47 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  35.77 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  28.67 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  28.67 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  35.1 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  34.58 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  32.39 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  31.85 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  28.19 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  28.99 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  28.33 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  33.6 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000378046 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  23.42 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  25.2 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  29.73 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  32.97 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  31.19 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  31.19 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  31.19 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  31.19 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  31.19 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  31.19 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  31.19 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  26.83 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05853  hypothetical protein  27.62 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  31.09 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  31.09 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  31.09 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  30.21 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  31.09 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  25.83 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  32.18 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  26.67 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  24.83 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  24.14 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  34.44 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  28.35 
 
 		 292 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  31.67 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  27.18 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  32.53 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  31.67 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  31.67 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  29.13 
 
 		 210 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000403231  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  29.13 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  28.17 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  33.7 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  23.93 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  23.93 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  23.93 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  27.27 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  29.55 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  39.77 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  30.93 
 
 		 202 aa  40.8  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  25.2 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2121  hypothetical protein  31.46 
 
 		 265 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>