134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2445 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  66.87 
 
 
163 aa  226  8e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  66.26 
 
 
163 aa  225  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  39.02 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  39.46 
 
 
160 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  36.75 
 
 
155 aa  90.9  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  34.62 
 
 
160 aa  90.5  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  35.26 
 
 
160 aa  90.5  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  34.62 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  36.42 
 
 
161 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  35.8 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  35.8 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  33.54 
 
 
160 aa  88.2  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  35.8 
 
 
161 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  38.78 
 
 
160 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  35.8 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  36.42 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  35.8 
 
 
161 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  35.8 
 
 
161 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  38.89 
 
 
161 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  38.41 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  38.22 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.44 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  38.27 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  35.26 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  36.11 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  32.72 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  27.85 
 
 
163 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  27.85 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  27.85 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  37.96 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  27.85 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  27.85 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  27.85 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  27.85 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  27.85 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  35.8 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  35.8 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  27.22 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  35.8 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  35.8 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  35.8 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  35.8 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  35.8 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  33.95 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3341  hypothetical protein  38.1 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.183081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5375  protein of unknown function DUF796  39.44 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330014  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  35.8 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  36.6 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  36.6 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  36.11 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  36.6 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  39.57 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  33.97 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  33.78 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  30.63 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  30.63 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  30.63 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  35.14 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  26.14 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2077  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.01 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00363318  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  30.32 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3302  putative cytoplasmic protein  30.32 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3476  hypothetical protein  30.32 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3382  putative cytoplasmic protein  30.32 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.963871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  28.66 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3308  putative cytoplasmic protein  30.32 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  30.72 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.03 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1899  hypothetical protein  29.63 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2076  hypothetical protein  29.63 
 
 
175 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0791  hypothetical protein  29.63 
 
 
175 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0702  hypothetical protein  29.63 
 
 
175 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3022  hypothetical protein  25.77 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.379437  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0440  hypothetical protein  29.63 
 
 
175 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  27.4 
 
 
164 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0747  hypothetical protein  29.63 
 
 
175 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1042  hypothetical protein  29.63 
 
 
175 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2016  hypothetical protein  29.63 
 
 
175 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.12 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  28.48 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6054  hypothetical protein  30.3 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932106  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  26.8 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  26.8 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1537  histidine kinase  27.89 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.48 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  28.31 
 
 
160 aa  58.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  28.03 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  27.16 
 
 
160 aa  57.4  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  28.03 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  26.54 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1633  hypothetical protein  35.24 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0155782  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  26.75 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4088  Hcp1 family type VI secretion system effector  27.04 
 
 
174 aa  53.9  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000845431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3837  hypothetical protein  24.69 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0274684  normal  0.040602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  32.89 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0741  hemolysin-coregulated protein (uncharacterized)-like protein  28.19 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  31.54 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.21 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4839  putative cytoplasmic protein  37.38 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>