54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2376 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2376  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  345  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0049  hypothetical protein  62.33 
 
 		 151 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.286188 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2503  hypothetical protein  60.76 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.984407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0845  hypothetical protein  60.76 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3130  hypothetical protein  58.86 
 
 		 164 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0041  hypothetical protein  62.07 
 
 		 164 aa  181  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0415  hypothetical protein  55.41 
 
 		 192 aa  171  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4087  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.74 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2951  hypothetical protein  49.66 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1770  hypothetical protein  47.5 
 
 		 178 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3057  hypothetical protein  53.6 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4226  hypothetical protein  43.79 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0966  hypothetical protein  45.86 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0334  hypothetical protein  46.75 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0085748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3762  hypothetical protein  43.95 
 
 		 173 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3635  hypothetical protein  49.28 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.514742  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1930  hypothetical protein  44.81 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2007  hypothetical protein  44.81 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100253  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0061  hypothetical protein  44.53 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1286  hypothetical protein  44.87 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5035  hypothetical protein  45.86 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.349078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  46.1 
 
 		 213 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  43.14 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1856  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.45 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  45.03 
 
 		 168 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1577  hypothetical protein  46.45 
 
 		 197 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.0747974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4106  hypothetical protein  49.62 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1662  hypothetical protein  49.63 
 
 		 197 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.35409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0228  hypothetical protein  43.7 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.202432  normal  0.354498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3423  hypothetical protein  52.31 
 
 		 204 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0043  hypothetical protein  47.45 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132531  normal  0.0395538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.85 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  43.14 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  42.86 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0176  hypothetical protein  45.07 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  42.48 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1401  hypothetical protein  50.75 
 
 		 177 aa  97.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0281  hypothetical protein  43.61 
 
 		 199 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2816  hypothetical protein  44.03 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  34.16 
 
 		 503 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  32.33 
 
 		 358 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  33.57 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  31.97 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3257  hypothetical protein  35.53 
 
 		 288 aa  58.2  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  32.18 
 
 		 275 aa  57.8  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  31.65 
 
 		 295 aa  51.6  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  30.56 
 
 		 253 aa  51.2  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.97 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  32.28 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  31.72 
 
 		 222 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.34 
 
 		 314 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04119  hypothetical protein  32.69 
 
 		 248 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  28.87 
 
 		 454 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  27.59 
 
 		 530 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>