271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2363 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 351 aa  696    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  51.56 
 
 		 364 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  50.99 
 
 		 364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  49.86 
 
 		 347 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  41.5 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  39.5 
 
 		 352 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  45.45 
 
 		 315 aa  219  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  41.2 
 
 		 314 aa  215  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  44.41 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  42.32 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  37.57 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  40.21 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  43.66 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  43 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  38.62 
 
 		 310 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  36.55 
 
 		 310 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  36.55 
 
 		 310 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  35.52 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 		 321 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  34.77 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  34.15 
 
 		 351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  31.1 
 
 		 323 aa  126  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  32.18 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  31.6 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  30.03 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  32.88 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  33.59 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  32.09 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.86 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  32.81 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  32.81 
 
 		 318 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  29.64 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 315 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.3 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  25.26 
 
 		 438 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 298 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 342 aa  92.8  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 597 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  29.69 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 317 aa  90.5  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  24.25 
 
 		 334 aa  90.1  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 		 321 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  30.27 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 		 315 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 334 aa  87  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  27.61 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  29.92 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  25.08 
 
 		 312 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.59 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  28.63 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  28.69 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  28.68 
 
 		 637 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  28.51 
 
 		 644 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  25.1 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  28.2 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  26.32 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  32.58 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  25.19 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.22 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  22.67 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  33.78 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.05 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  25.57 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  28.97 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  25.57 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  27.37 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>