59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2320 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  767    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  48.91 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  46.2 
 
 		 361 aa  291  9e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  47.32 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  47.32 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  48.11 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  43.81 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  35.25 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  33.21 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  36.49 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  34.93 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  34.93 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  34.93 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  33.97 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  33.49 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  38.35 
 
 		 514 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  31.68 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  32.12 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  32.12 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  33.01 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  33.01 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  36.19 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  33.01 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  32.69 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  32.21 
 
 		 523 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  30.82 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  30.22 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  30.99 
 
 		 530 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  37.74 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  30.69 
 
 		 595 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  32.03 
 
 		 721 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  31.35 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  30.39 
 
 		 777 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  29.85 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  29.58 
 
 		 407 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  30.07 
 
 		 407 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  26.04 
 
 		 831 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  29.24 
 
 		 566 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  26.33 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  25.48 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  28.3 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  27.47 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  30.52 
 
 		 746 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  28.12 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  26.42 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 		 632 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  32.32 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  29.6 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  29.15 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  25.94 
 
 		 503 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  26.14 
 
 		 539 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  32.69 
 
 		 498 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  24.4 
 
 		 520 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  28.06 
 
 		 530 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  26.42 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  29.03 
 
 		 800 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  27.09 
 
 		 802 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  27.09 
 
 		 769 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  27.09 
 
 		 769 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>