177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2315 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  853    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  36.22 
 
 
579 aa  237  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  37.33 
 
 
302 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.16 
 
 
321 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  38.59 
 
 
321 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  36.72 
 
 
321 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  34.37 
 
 
312 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  32.89 
 
 
305 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  32.82 
 
 
312 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  31.9 
 
 
312 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  30.43 
 
 
312 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  31.17 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  32.36 
 
 
313 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  29.35 
 
 
312 aa  130  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  31.06 
 
 
308 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  31.06 
 
 
308 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  30.43 
 
 
306 aa  126  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  31.35 
 
 
313 aa  126  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.92 
 
 
275 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  30.38 
 
 
307 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  29.06 
 
 
312 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  24.84 
 
 
456 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  31.3 
 
 
312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  30.18 
 
 
312 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  30.18 
 
 
312 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.02 
 
 
296 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  24.36 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  29.59 
 
 
360 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  29.59 
 
 
360 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.18 
 
 
296 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.32 
 
 
296 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  30.59 
 
 
308 aa  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  29.59 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  34.98 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  29.93 
 
 
315 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  33.08 
 
 
313 aa  110  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  23.91 
 
 
455 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  27.01 
 
 
360 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  25.52 
 
 
353 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  28.91 
 
 
359 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  28.74 
 
 
359 aa  106  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  29.59 
 
 
319 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  26.05 
 
 
458 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  29.51 
 
 
357 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  25.76 
 
 
458 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  25.91 
 
 
313 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  26.87 
 
 
307 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.81 
 
 
292 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  26.53 
 
 
307 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  28.63 
 
 
312 aa  100  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  27.73 
 
 
307 aa  99.8  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.56 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  27.19 
 
 
331 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  28.26 
 
 
297 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  29.97 
 
 
313 aa  96.3  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  32.71 
 
 
295 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  30.33 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  29.93 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.19 
 
 
331 aa  94.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  29.93 
 
 
325 aa  94.4  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  22.42 
 
 
308 aa  94  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.42 
 
 
308 aa  94  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  29.86 
 
 
313 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  27.33 
 
 
289 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  33.86 
 
 
293 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  28.25 
 
 
323 aa  90.1  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  28.11 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  30.53 
 
 
317 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  31.67 
 
 
300 aa  87.4  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  30.09 
 
 
291 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  29.69 
 
 
321 aa  86.7  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  25.24 
 
 
334 aa  85.9  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  25.12 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  28.01 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  30.99 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  32.81 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  24.11 
 
 
298 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  27.78 
 
 
312 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  24.59 
 
 
301 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  22.07 
 
 
288 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  23.61 
 
 
313 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  27.78 
 
 
312 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  27.32 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  28.21 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  27.64 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  26.72 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  31.22 
 
 
322 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  29.53 
 
 
309 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  26.98 
 
 
313 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  32.02 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  32.02 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3915  hypothetical protein  31.05 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  37.61 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  31.53 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  31.53 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  25.35 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  34.19 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  31.03 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  35.9 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  27.5 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>