More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2303 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2303  chaperone protein DnaJ  100 
 
 		 384 aa  786    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0682598  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  75.77 
 
 		 382 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  75.52 
 
 		 382 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  76.03 
 
 		 382 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3570  chaperone protein DnaJ  70.88 
 
 		 383 aa  534  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  69.15 
 
 		 385 aa  533  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  69.23 
 
 		 385 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 		 372 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  58.4 
 
 		 388 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  60.88 
 
 		 385 aa  451  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  57.44 
 
 		 375 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6271  chaperone protein DnaJ  55.9 
 
 		 387 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6930  chaperone protein DnaJ  56.04 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2961  chaperone protein DnaJ  56.1 
 
 		 385 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.271615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3143  chaperone protein DnaJ  56.14 
 
 		 383 aa  425  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2956  chaperone protein DnaJ  55.06 
 
 		 382 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2126  chaperone protein DnaJ  58.58 
 
 		 377 aa  421  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.549127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3187  chaperone protein DnaJ  55.84 
 
 		 385 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117357 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0789  chaperone protein DnaJ  58.05 
 
 		 377 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  56.81 
 
 		 374 aa  421  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  54.9 
 
 		 380 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2042  chaperone protein DnaJ  58.31 
 
 		 377 aa  418  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280436  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  56.88 
 
 		 376 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3920  chaperone protein DnaJ  55.24 
 
 		 380 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0757957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4415  chaperone protein DnaJ  56.36 
 
 		 375 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  56.58 
 
 		 379 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  53.7 
 
 		 375 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0430  chaperone protein DnaJ  56.88 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  52.45 
 
 		 376 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  52.45 
 
 		 376 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  52.45 
 
 		 376 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  54.01 
 
 		 375 aa  401  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  54.64 
 
 		 374 aa  401  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  55.29 
 
 		 379 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0390  chaperone protein DnaJ  55.41 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  52.45 
 
 		 376 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  52.71 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  52.2 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  52.45 
 
 		 376 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  52.71 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  52.45 
 
 		 376 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0337  chaperone protein DnaJ  55.94 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  52.71 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  52.45 
 
 		 376 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  54.78 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  52.45 
 
 		 376 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  52.71 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  52.97 
 
 		 381 aa  400  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  52.71 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  53.51 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0198  chaperone protein DnaJ  54.62 
 
 		 378 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  54.29 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  52.97 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  52.97 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  53.11 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  52.97 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  54.52 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  55.67 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  51.96 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  51.79 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0156  chaperone protein DnaJ  54.62 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  53.77 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  52.31 
 
 		 378 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  52.59 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  53.77 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  53.51 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  52.05 
 
 		 378 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  54.15 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  53.89 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  51.94 
 
 		 378 aa  381  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  52.33 
 
 		 376 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4504  dnaJ protein  55.67 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  53.4 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0006  chaperone protein DnaJ  52.31 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  53.63 
 
 		 375 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  53 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  51.15 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  53.11 
 
 		 376 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  54.15 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  53.89 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  53.89 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  53.89 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  54.4 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  52.59 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  53.63 
 
 		 377 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  53.63 
 
 		 377 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  51.68 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  51.29 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  53.63 
 
 		 377 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2999  chaperone protein DnaJ  55.13 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.905644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  53.37 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  51.94 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  53.49 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  48.84 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  52.2 
 
 		 380 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  52.59 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  54.01 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>