More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2296 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 332 aa  683    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  75 
 
 		 327 aa  504  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  71.47 
 
 		 328 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  71.78 
 
 		 328 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  71.6 
 
 		 328 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  53.85 
 
 		 332 aa  349  3e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  53.68 
 
 		 332 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  51.98 
 
 		 324 aa  337  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  51.82 
 
 		 329 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 		 327 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 		 327 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  52.76 
 
 		 332 aa  329  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  52.31 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 		 332 aa  326  4.0000000000000003e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 337 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  51.69 
 
 		 332 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  51.38 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  47.68 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  51.07 
 
 		 332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 		 323 aa  310  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  51.08 
 
 		 329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 330 aa  308  8e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 		 326 aa  308  8e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  49.07 
 
 		 337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 330 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 330 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  47.87 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  49.85 
 
 		 330 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  45.43 
 
 		 326 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  46.63 
 
 		 333 aa  301  8.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 330 aa  301  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  44.79 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  46.15 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  48.3 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  47.37 
 
 		 329 aa  296  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  48.32 
 
 		 331 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  48.32 
 
 		 327 aa  295  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  48 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  48.61 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  47.4 
 
 		 328 aa  292  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  44.24 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  45.82 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  44.58 
 
 		 328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  45.29 
 
 		 327 aa  288  6e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  45.71 
 
 		 330 aa  288  9e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  43.6 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  45.59 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  49.37 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  48.61 
 
 		 328 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  49 
 
 		 356 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  46.42 
 
 		 354 aa  285  9e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  46.27 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  46.84 
 
 		 328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  45.29 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  46.85 
 
 		 349 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  45.82 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  47.53 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  47.66 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  47.53 
 
 		 337 aa  279  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  46.23 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  46.22 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 327 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  45.2 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  45.06 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  47.53 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  46.58 
 
 		 334 aa  272  7e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  44.44 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  43.98 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  44 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  45.76 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  44.14 
 
 		 326 aa  270  4e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  46.06 
 
 		 327 aa  270  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  43.52 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  44.05 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  46.77 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  43.81 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  43.81 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  46.6 
 
 		 326 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  43.65 
 
 		 329 aa  265  8.999999999999999e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 		 351 aa  264  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  45.12 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  44.79 
 
 		 333 aa  263  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>