49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2287 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  381  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  51.19 
 
 
177 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  51.19 
 
 
177 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  56.52 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  49.2 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  50.6 
 
 
176 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  52.47 
 
 
166 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  52.47 
 
 
166 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  57.05 
 
 
168 aa  151  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  50.92 
 
 
172 aa  151  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  50.62 
 
 
172 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  48.81 
 
 
176 aa  148  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  52.9 
 
 
173 aa  144  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  47.65 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  44.55 
 
 
202 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  44.95 
 
 
232 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  50.3 
 
 
179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  44.17 
 
 
166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  48.1 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  42.26 
 
 
182 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  47.53 
 
 
169 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  49.41 
 
 
174 aa  124  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  51.27 
 
 
173 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  41.71 
 
 
206 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  40.12 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  41.07 
 
 
173 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  53.09 
 
 
165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  40.37 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  40.37 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  43.2 
 
 
170 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  40.13 
 
 
301 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  37.74 
 
 
172 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  38.55 
 
 
167 aa  104  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  40.99 
 
 
168 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  33.33 
 
 
168 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  41.61 
 
 
165 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  38.89 
 
 
249 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  31.71 
 
 
163 aa  89.4  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  46.67 
 
 
91 aa  84  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  38.92 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  41.84 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  32.7 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  25.54 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  35.07 
 
 
160 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4002  hypothetical protein  25 
 
 
148 aa  61.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3602  membrane protein of unknown function UCP014873  31.52 
 
 
174 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1377  membrane protein-like  52.78 
 
 
56 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0588  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.09 
 
 
642 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.09 
 
 
642 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>