More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2266 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  309  9e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  77.63 
 
 		 152 aa  245  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  76.97 
 
 		 152 aa  244  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  76.32 
 
 		 152 aa  241  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  74 
 
 		 153 aa  227  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  69.74 
 
 		 160 aa  217  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  69.28 
 
 		 169 aa  215  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 174 aa  179  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  50.66 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  51.33 
 
 		 157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  56.34 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 156 aa  153  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  50 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  49.34 
 
 		 152 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  50.33 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  49.34 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  49.34 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  49.34 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 155 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 155 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  47.02 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  49.66 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  49.66 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 176 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  48.7 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 147 aa  141  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  48.03 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 172 aa  140  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  42.38 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.11 
 
 		 156 aa  140  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  45.34 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.41 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05577  transcription regulator protein  44.67 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  46.71 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  50.35 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  45.86 
 
 		 162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 164 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  45.22 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  45.22 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  40.79 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.36 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>