More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2209 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  337  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  83.23 
 
 
166 aa  275  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  83.23 
 
 
166 aa  275  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  83.23 
 
 
166 aa  275  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  81.99 
 
 
166 aa  268  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  76.36 
 
 
166 aa  267  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  77.91 
 
 
166 aa  261  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  75 
 
 
161 aa  247  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  69.93 
 
 
155 aa  217  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  64.97 
 
 
157 aa  210  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  64.1 
 
 
158 aa  208  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  63.23 
 
 
159 aa  197  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  63.82 
 
 
159 aa  193  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  63.16 
 
 
170 aa  192  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  61.94 
 
 
158 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  62.5 
 
 
160 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  62.5 
 
 
176 aa  190  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  59.21 
 
 
180 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  61.84 
 
 
160 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  58.94 
 
 
170 aa  176  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  58.82 
 
 
156 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  59.6 
 
 
156 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  60.14 
 
 
156 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  60.14 
 
 
156 aa  174  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  60.14 
 
 
156 aa  174  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  59.48 
 
 
168 aa  175  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  60.14 
 
 
155 aa  174  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  60.42 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  59.46 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  60.69 
 
 
175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  57.82 
 
 
157 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
153 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
181 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
153 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.62 
 
 
153 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
157 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  41.06 
 
 
157 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  49.32 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  41.51 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
161 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
175 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
165 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  40.74 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  39.88 
 
 
174 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 
153 aa  124  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
171 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
152 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  40.74 
 
 
162 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  40.74 
 
 
162 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
177 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
152 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
158 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
155 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
152 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
155 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
152 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
154 aa  123  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
155 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
152 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 
174 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
165 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 
174 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 
174 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 
174 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
160 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
156 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  39.41 
 
 
218 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  42.95 
 
 
152 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
159 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  39.63 
 
 
165 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
156 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
156 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  46.98 
 
 
151 aa  121  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
196 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
175 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
153 aa  121  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 
168 aa  121  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
154 aa  121  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
167 aa  121  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
152 aa  121  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  46.71 
 
 
168 aa  121  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  44.29 
 
 
150 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  39.35 
 
 
167 aa  120  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 
150 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
175 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  38.71 
 
 
167 aa  120  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>