232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2205 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2205  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
136 aa  274  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  73.88 
 
 
172 aa  210  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0683  heat shock protein  70.37 
 
 
147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0489966  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1572  HSP20 family protein  69.34 
 
 
155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.583414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0224  heat shock protein Hsp20  69.34 
 
 
155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.953259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3054  heat shock protein Hsp20  69.85 
 
 
155 aa  193  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0610  heat shock protein Hsp20  65.44 
 
 
137 aa  188  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0408  heat shock protein Hsp20  62.02 
 
 
167 aa  166  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0188  heat shock protein Hsp20  59.85 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3755  heat shock protein Hsp20  58.39 
 
 
182 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0341  heat shock protein Hsp20  61.83 
 
 
162 aa  160  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0137519  normal  0.0838875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0056  heat shock protein Hsp20  54.68 
 
 
141 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0115  putative small heat shock protein  54.68 
 
 
141 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.652181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0182  heat shock protein Hsp20  53.96 
 
 
141 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0651  heat shock protein Hsp20  53.24 
 
 
141 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0518672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0409  heat shock protein Hsp20  53.96 
 
 
141 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0211  heat shock protein Hsp20  53.96 
 
 
141 aa  151  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4738  heat shock protein Hsp20  54.93 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4228  heat shock protein Hsp20  55.63 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00904113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0167  heat shock protein Hsp20  53.9 
 
 
143 aa  150  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1616  heat shock protein Hsp20  55.63 
 
 
143 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0212201  hitchhiker  0.00491481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0174  heat shock protein Hsp20  55.71 
 
 
140 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743685  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0163  HSP20 family protein  54.29 
 
 
160 aa  148  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3663  heat shock protein Hsp20  55.32 
 
 
141 aa  148  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.728714  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3162  heat shock protein Hsp20  58.27 
 
 
142 aa  148  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0157  HSP20 family protein  54.29 
 
 
160 aa  148  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1620  heat shock protein Hsp20  54.93 
 
 
143 aa  147  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0107266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1902  heat shock protein Hsp20  54.93 
 
 
143 aa  147  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0049  heat shock protein Hsp20  54.61 
 
 
143 aa  147  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000515794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2032  heat shock protein Hsp20  53.28 
 
 
141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0010  heat shock protein Hsp20  52.52 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0010  heat shock protein Hsp20  52.52 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138244  normal  0.090985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0512  heat shock protein Hsp20  54.29 
 
 
166 aa  141  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4963  heat shock protein Hsp20  54.01 
 
 
141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971356  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  53.85 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  52.14 
 
 
147 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  52.14 
 
 
147 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  52.14 
 
 
147 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  52.14 
 
 
147 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  52.14 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  53.85 
 
 
146 aa  127  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  52.14 
 
 
147 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  52.99 
 
 
146 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  51.28 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  51.28 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  51.28 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  53.39 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  53.78 
 
 
150 aa  124  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  48.28 
 
 
148 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  52.99 
 
 
147 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  52.99 
 
 
148 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  50.82 
 
 
156 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  46.55 
 
 
144 aa  120  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  49.21 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  49.24 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  48.41 
 
 
153 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0619  heat shock protein Hsp20  47.62 
 
 
176 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  50.43 
 
 
155 aa  116  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  47.86 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  47.86 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0763  heat shock protein Hsp20  48.84 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.50457 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2632  heat shock protein Hsp20  49.14 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  47.86 
 
 
145 aa  114  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  51.72 
 
 
160 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1883  heat shock protein Hsp20  48 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  47.01 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0447  small heat shock protein  45.39 
 
 
142 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1668  small heat shock protein IbpA (16 kDa heat shock protein A)  46.15 
 
 
139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  49.57 
 
 
155 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  45.16 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  48.03 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  48.74 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  44.26 
 
 
155 aa  111  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3020  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
165 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  49.58 
 
 
156 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  45.67 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  48.74 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  49.14 
 
 
154 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2505  heat shock protein Hsp20  47.58 
 
 
153 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  49.58 
 
 
156 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1600  aminodeoxychorismate lyase  43.65 
 
 
169 aa  110  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000328737  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  45.3 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  47.24 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1372  heat shock protein HSP20  46.03 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  45.3 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  44.07 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  48.41 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  47.9 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  48.72 
 
 
153 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2501  heat shock protein Hsp20  46.61 
 
 
158 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  46.55 
 
 
149 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1982  heat shock protein Hsp20  46.83 
 
 
149 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.01007  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3510  heat shock protein Hsp20  45.6 
 
 
170 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.420499  normal  0.371318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3777  heat shock protein Hsp20  46.83 
 
 
147 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.732741 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  42.02 
 
 
152 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4636  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
158 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5555  heat shock protein Hsp20  45.76 
 
 
158 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  47.86 
 
 
156 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>