More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2159 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  65.79 
 
 		 506 aa  661    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  63.97 
 
 		 506 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  64.57 
 
 		 511 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  65.18 
 
 		 506 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2159  ABC transporter related  100 
 
 		 500 aa  1014    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.634503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  64.98 
 
 		 506 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  64.78 
 
 		 528 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5464  ABC transporter related  64.78 
 
 		 506 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3548  ABC transporter related  64.78 
 
 		 506 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  64.78 
 
 		 506 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  62.88 
 
 		 497 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2434  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  63.29 
 
 		 540 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936114  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  58.7 
 
 		 501 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1197  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  62.27 
 
 		 506 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1641  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  62.27 
 
 		 534 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0578251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0303  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  62.27 
 
 		 535 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0120484  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1908  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  62.27 
 
 		 535 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00738158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1921  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  62.27 
 
 		 535 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0857  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  62.27 
 
 		 535 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2070  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  62.07 
 
 		 859 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0501003  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 496 aa  551  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 496 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  57.32 
 
 		 496 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.33 
 
 		 492 aa  427  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  46.88 
 
 		 497 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  44.51 
 
 		 501 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.51 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  44.83 
 
 		 514 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  44.89 
 
 		 516 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  45.23 
 
 		 499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  43.95 
 
 		 504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  44.91 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.2 
 
 		 513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  45.23 
 
 		 499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  45.03 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43 
 
 		 512 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  44.38 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  44.38 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  43 
 
 		 513 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  44.13 
 
 		 492 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  44.38 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  43.64 
 
 		 520 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.8 
 
 		 512 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  42.83 
 
 		 514 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.03 
 
 		 512 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.74 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  43.03 
 
 		 512 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  43.75 
 
 		 503 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  43.43 
 
 		 515 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  42.74 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.15 
 
 		 494 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  43.61 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  42.54 
 
 		 524 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.54 
 
 		 527 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 494 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  43.72 
 
 		 496 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.87 
 
 		 524 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  43.26 
 
 		 517 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.54 
 
 		 524 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  41.9 
 
 		 505 aa  395  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.87 
 
 		 524 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  43.93 
 
 		 496 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  45.47 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  41.88 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.48 
 
 		 524 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  44.65 
 
 		 508 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.52 
 
 		 494 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 525 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  44.15 
 
 		 517 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  44.69 
 
 		 508 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.6 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  45.89 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  41.46 
 
 		 499 aa  395  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  41.87 
 
 		 524 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  43.5 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  43.29 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.89 
 
 		 494 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  44.24 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.35 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  42.71 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  41.09 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  42.02 
 
 		 524 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  42.94 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  43.94 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  41.34 
 
 		 492 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  41.67 
 
 		 518 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  41.77 
 
 		 525 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  40.4 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.3 
 
 		 494 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  40.85 
 
 		 516 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  43.43 
 
 		 500 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.9 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  43.98 
 
 		 506 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  44.27 
 
 		 507 aa  385  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>