More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2136 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2136  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.198158  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2002  anthranilate synthase component II  72.04 
 
 
195 aa  276  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.387565  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0712  anthranilate synthase component II  72.04 
 
 
195 aa  276  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.089943 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3099  anthranilate synthase component II  70.97 
 
 
193 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.757854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3171  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  66.84 
 
 
197 aa  263  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.511386  normal  0.171933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1880  anthranilate synthase, component II  67.02 
 
 
195 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.573908  normal  0.0815956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1401  anthranilate synthase component II  68.82 
 
 
196 aa  261  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.579045  hitchhiker  0.000682875 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1798  anthranilate synthase component II  66.15 
 
 
201 aa  260  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000393532  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1141  anthranilate synthase component II  64.89 
 
 
193 aa  259  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3227  anthranilate synthase, component II  62.03 
 
 
206 aa  246  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2022  anthranilate synthase, component II  63.49 
 
 
195 aa  244  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.359066  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0147  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.43 
 
 
188 aa  242  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0078  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  55.79 
 
 
195 aa  241  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000982059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2564  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  59.36 
 
 
189 aa  241  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5239  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  55.79 
 
 
195 aa  241  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2861  anthranilate synthase component II  59.57 
 
 
195 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  55.79 
 
 
195 aa  240  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  55.79 
 
 
195 aa  240  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  55.26 
 
 
195 aa  240  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  55.79 
 
 
195 aa  240  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2910  anthranilate synthase component II  60.11 
 
 
196 aa  240  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0081  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  55.79 
 
 
195 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  58.29 
 
 
187 aa  240  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0077  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  55.26 
 
 
195 aa  239  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  59.14 
 
 
204 aa  239  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2699  anthranilate synthase component II  57.14 
 
 
195 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  55.26 
 
 
195 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  58.82 
 
 
188 aa  238  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.708014  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4670  para-aminobenzoate synthase component II  61.17 
 
 
187 aa  238  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.234421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0907  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.68 
 
 
201 aa  238  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000149415  hitchhiker  0.00000000332325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03211  para-aminobenzoate synthase component II  61.7 
 
 
187 aa  238  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0352  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  61.7 
 
 
187 aa  238  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365633  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03163  hypothetical protein  61.7 
 
 
187 aa  238  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363246  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3557  para-aminobenzoate synthase component II  61.7 
 
 
187 aa  238  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3557  anthranilate synthase component II  59.36 
 
 
196 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  61.7 
 
 
187 aa  238  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3620  anthranilate synthase component II  59.36 
 
 
196 aa  237  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0352  para-aminobenzoate synthase component II  61.7 
 
 
187 aa  237  8e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  59.57 
 
 
187 aa  237  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3124  anthranilate synthase component II  56.91 
 
 
189 aa  237  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680889 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  59.57 
 
 
187 aa  237  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0068  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  54.74 
 
 
195 aa  237  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  59.57 
 
 
187 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0532  anthranilate synthase component II  59.36 
 
 
196 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0941  anthranilate synthase component II  59.36 
 
 
196 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  59.18 
 
 
195 aa  236  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3576  anthranilate synthase component II  59.36 
 
 
196 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3584  anthranilate synthase component II  59.36 
 
 
196 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2468  anthranilate synthase component II  57.75 
 
 
188 aa  236  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3642  para-aminobenzoate synthase component II  61.17 
 
 
187 aa  236  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1911  anthranilate synthase component II  59.36 
 
 
196 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0157  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  63.44 
 
 
198 aa  237  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0645  anthranilate synthase component II  59.36 
 
 
196 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  62.57 
 
 
190 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  59.04 
 
 
190 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  59.57 
 
 
187 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  62.57 
 
 
190 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2759  anthranilate synthase component II  56.38 
 
 
189 aa  235  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0462  anthranilate synthase component II  59.04 
 
 
199 aa  235  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0460  anthranilate synthase component II  58.51 
 
 
200 aa  235  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2572  anthranilate synthase component II  59.57 
 
 
199 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0505  anthranilate synthase component II  59.57 
 
 
199 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.624854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0438  anthranilate synthase component II  59.04 
 
 
199 aa  235  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0533  anthranilate synthase component II  59.57 
 
 
199 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2882  anthranilate synthase component II  56.91 
 
 
189 aa  235  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  55.08 
 
 
192 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  53.4 
 
 
195 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2224  anthranilate synthase component II  58.82 
 
 
189 aa  234  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.626919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3497  anthranilate synthase component II  57.98 
 
 
200 aa  234  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.317495  hitchhiker  0.000454644 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3736  para-aminobenzoate synthase component II  61.83 
 
 
187 aa  234  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2801  anthranilate synthase component II  61.58 
 
 
202 aa  234  8e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1895  anthranilate synthase, component II  62.37 
 
 
196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.408406  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3740  para-aminobenzoate synthase component II  58.51 
 
 
187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.780045  decreased coverage  0.00646888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0034  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  56.91 
 
 
223 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2081  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.59 
 
 
197 aa  232  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2261  anthranilate synthase component II  58.82 
 
 
189 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  62.37 
 
 
544 aa  232  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4377  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.75 
 
 
200 aa  232  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396938  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  59.89 
 
 
190 aa  231  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3787  para-aminobenzoate synthase component II  57.98 
 
 
187 aa  230  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1955  anthranilate synthase component II  58.29 
 
 
189 aa  230  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1732  anthranilate synthase component II  59.36 
 
 
191 aa  230  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3179  anthranilate synthase component II  58.82 
 
 
189 aa  230  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1454  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.68 
 
 
188 aa  229  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0597  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  61.83 
 
 
199 aa  229  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  57.22 
 
 
189 aa  229  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60.62 
 
 
197 aa  229  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  59.14 
 
 
188 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  58.55 
 
 
201 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2776  anthranilate synthase component II  58.6 
 
 
198 aa  228  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000091878  hitchhiker  0.00000280107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0583  anthranilate synthase component II  57.3 
 
 
190 aa  227  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3855  para-aminobenzoate synthase component II  57.07 
 
 
191 aa  226  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0526  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.21 
 
 
202 aa  226  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  58.55 
 
 
201 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4034  para-aminobenzoate synthase component II  56.54 
 
 
238 aa  226  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0356  anthranilate synthase component II  62.37 
 
 
189 aa  226  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.369979  normal  0.760779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0768  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  57.07 
 
 
195 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2155  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  59.68 
 
 
188 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64084  hitchhiker  0.0020762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3024  anthranilate synthase component II  57.22 
 
 
205 aa  225  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00296432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  54.3 
 
 
192 aa  224  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>