20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2083 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2083  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  565  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.064212 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3496  hypothetical protein  87.77 
 
 		 335 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3808  hypothetical protein  87.77 
 
 		 278 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2835  hypothetical protein  87.05 
 
 		 277 aa  495  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.868461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1999  hypothetical protein  75.54 
 
 		 278 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214007  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0002  hypothetical protein  38.13 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1210  hypothetical protein  38.04 
 
 		 395 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4566  hypothetical protein  39.15 
 
 		 380 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1176  hypothetical protein  36.26 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127226 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1919  hypothetical protein  47.41 
 
 		 576 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  unclonable  0.0000000000840766  unclonable  7.47349e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2311  hypothetical protein  39.13 
 
 		 595 aa  99  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000201823  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0468  hypothetical protein  46.67 
 
 		 103 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.745097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3223  hypothetical protein  34.33 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  44.74 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  30.07 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2528  hypothetical protein  22.4 
 
 		 431 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000441271  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0025  hypothetical protein  22.4 
 
 		 418 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000509485  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0025  hypothetical protein  22.4 
 
 		 418 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000254674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  32.47 
 
 		 226 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>