More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2029 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  100 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  63.49 
 
 		 271 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  63.49 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  62.66 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  54.1 
 
 		 262 aa  244  9e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  53.28 
 
 		 247 aa  238  6.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  48 
 
 		 256 aa  205  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  47.56 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  44.88 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  40.73 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  43.84 
 
 		 288 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  45.78 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  40.93 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  45.75 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  38.91 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  39.84 
 
 		 261 aa  123  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  41.48 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  40.18 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  45.45 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  39.75 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  37.8 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  37.8 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  36.65 
 
 		 272 aa  109  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  40.49 
 
 		 242 aa  106  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  36.68 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  41.94 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  30.39 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  32.91 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  23.83 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  31.92 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  31.98 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  26.86 
 
 		 233 aa  92.4  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  27.04 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  27.04 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  27.31 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  23.98 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  21.5 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  37.65 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  25.89 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  30.63 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  33.62 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  28.57 
 
 		 237 aa  86.7  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  36.11 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  24.39 
 
 		 233 aa  85.5  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  23.9 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  23.04 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  32.23 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  32.02 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  30.64 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  34.01 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  27.13 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  26.12 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  26.12 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  27.13 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  33.92 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  26.8 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  26.72 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  26.72 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  26.72 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  31.91 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  26.72 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  28.12 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  26.52 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  26.72 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  33.19 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  25.71 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  30.95 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  32.27 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  33.81 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  30.56 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  34.82 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  21.49 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  27.97 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  30 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  31.36 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  26.51 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  26.56 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  29.66 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  29.66 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  21.53 
 
 		 230 aa  72  0.000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  24.89 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  30.88 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  23.56 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  30.88 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  30.88 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  27.48 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  25.12 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  31.73 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  25.23 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  34.71 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  26.39 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  21.86 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  32.18 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  27.39 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  22.27 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  27.49 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  25.89 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>