More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2027 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2027  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 		 241 aa  493  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  91.67 
 
 		 241 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0747  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  89.21 
 
 		 240 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2402  acetoacetyl-CoA reductase  89.21 
 
 		 240 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  82.57 
 
 		 241 aa  417  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3821  acetoacetyl-CoA reductase  81.33 
 
 		 241 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  79.58 
 
 		 241 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.738636 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3116  acetoacetyl-CoA reductase  82.92 
 
 		 241 aa  394  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.937548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3067  acetoacetyl-CoA reductase  77.59 
 
 		 240 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3375  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  74.17 
 
 		 240 aa  377  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0492  acetoacetyl-CoA reductase  75.93 
 
 		 240 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  73.75 
 
 		 241 aa  374  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  73.44 
 
 		 241 aa  371  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  73.75 
 
 		 241 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  72.5 
 
 		 241 aa  362  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3736  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  73.44 
 
 		 240 aa  361  5.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  72.92 
 
 		 241 aa  359  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  73.33 
 
 		 241 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  71.97 
 
 		 241 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  72.2 
 
 		 241 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  72.27 
 
 		 241 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  72.27 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  71.13 
 
 		 240 aa  352  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1574  acetoacetyl-CoA reductase  67.92 
 
 		 241 aa  337  9e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50991  normal  0.311491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  69.33 
 
 		 242 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  68.07 
 
 		 242 aa  330  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  68.07 
 
 		 242 aa  330  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  66.25 
 
 		 240 aa  323  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  65.27 
 
 		 242 aa  316  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  64.85 
 
 		 242 aa  315  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  65.27 
 
 		 242 aa  314  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  64.44 
 
 		 242 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  63.75 
 
 		 240 aa  311  6.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  64.71 
 
 		 242 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  61.34 
 
 		 240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  62.24 
 
 		 241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.503632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  62.92 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  62.92 
 
 		 241 aa  298  8e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2753  acetoacetyl-CoA reductase  63.03 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  60.42 
 
 		 240 aa  291  8e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1946  acetoacetyl-CoA reductase  59.58 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3065  acetoacetyl-CoA reductase  56.3 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000577101  normal  0.0493909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  54.69 
 
 		 246 aa  264  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  54.32 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.5 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  52.26 
 
 		 247 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.24 
 
 		 246 aa  251  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  53.11 
 
 		 248 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  53.09 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  56.61 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.67 
 
 		 247 aa  245  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  52.44 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  52.63 
 
 		 246 aa  242  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  51.82 
 
 		 246 aa  241  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.97 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  52.28 
 
 		 248 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 		 268 aa  240  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  52.28 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  51.87 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  50.21 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  50.61 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.33 
 
 		 246 aa  238  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.64 
 
 		 236 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  50.21 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  50.64 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  53.75 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  53.33 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  47.92 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  47.92 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  52.92 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  52.08 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.02 
 
 		 248 aa  231  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  51.67 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  52.5 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.08 
 
 		 245 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.5 
 
 		 245 aa  230  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  50.83 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  52.08 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.46 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  52.08 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  46.89 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  53.88 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3029  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.88 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  52.08 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  52.08 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  52.08 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>