41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2016 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  591  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  62.77 
 
 		 297 aa  316  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  65.25 
 
 		 300 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  65.25 
 
 		 300 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  60.42 
 
 		 300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  64.89 
 
 		 300 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  63.83 
 
 		 297 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  29.25 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  35.68 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  35.84 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  33.21 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  37.74 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  28.96 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  41.84 
 
 		 323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  34.12 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  29.29 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  39.01 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  39.01 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  29.15 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  31.83 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  34.91 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  31.96 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  34.43 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  28.43 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  28.43 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  27.48 
 
 		 347 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  34.04 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  36.2 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  32.52 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  32.55 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  31.45 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  32.97 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  31.14 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  27.87 
 
 		 339 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  28.42 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  33.04 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  29.91 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  32.54 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  36.31 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  27.89 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  31.08 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>