More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1938 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1238  cytochrome c oxidase, subunit I  62.64 
 
 		 554 aa  654    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28366 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2383  cytochrome c oxidase subunit 1  82.47 
 
 		 558 aa  934    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  61.14 
 
 		 542 aa  657    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  62.36 
 
 		 540 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  61.07 
 
 		 542 aa  645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  61.62 
 
 		 542 aa  650    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  61.61 
 
 		 542 aa  653    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1877  cytochrome c oxidase, aa3 type, subunit I  81.87 
 
 		 566 aa  940    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0527  cytochrome-c oxidase  81.69 
 
 		 566 aa  939    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  59.78 
 
 		 532 aa  652    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  61.32 
 
 		 542 aa  658    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0519  cytochrome c oxidase subunit I type  63.16 
 
 		 562 aa  646    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  62.19 
 
 		 555 aa  672    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0474  cytochrome c oxidase, subunit I  62.25 
 
 		 552 aa  642    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  61.69 
 
 		 562 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1250  cytochrome-c oxidase  79.05 
 
 		 628 aa  769    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.390629  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  65.17 
 
 		 559 aa  664    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2291  cytochrome-c oxidase  80.29 
 
 		 552 aa  931    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0643  cytochrome c oxidase, subunit I  64.79 
 
 		 567 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.365928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0664  cytochrome-c oxidase  82.22 
 
 		 566 aa  947    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.182209  normal  0.0365903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  62.83 
 
 		 541 aa  635    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0603  cytochrome c oxidase, subunit I  64.61 
 
 		 565 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  61.07 
 
 		 542 aa  645    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1938  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 558 aa  1134    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.652657  normal  0.0264724 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3028  cytochrome-c oxidase  91.94 
 
 		 556 aa  1046    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  62.48 
 
 		 535 aa  634  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0582  cytochrome c oxidase subunit I type  62.43 
 
 		 552 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000068814  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3876  cytochrome c oxidase, subunit I  60.98 
 
 		 562 aa  629  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  60.58 
 
 		 540 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1404  cytochrome-c oxidase  62.43 
 
 		 556 aa  630  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.29775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  61.71 
 
 		 534 aa  627  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0468  cytochrome c oxidase, subunit I  62.43 
 
 		 552 aa  623  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  61.89 
 
 		 541 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  60.87 
 
 		 537 aa  618  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4505  cytochrome c oxidase, subunit I  61.16 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2233  cytochrome-c oxidase  59.49 
 
 		 544 aa  620  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.321922  hitchhiker  0.00969902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0815  cytochrome-c oxidase  62.08 
 
 		 541 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0856305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0742  cytochrome c oxidase, subunit I  61.27 
 
 		 550 aa  617  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0108973  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0224  cytochrome c oxidase, subunit I  61.65 
 
 		 539 aa  611  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0762  cytochrome c oxidase, subunit I  61.65 
 
 		 539 aa  611  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0256  cytochrome-c oxidase  61.47 
 
 		 537 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3462  cytochrome-c oxidase  61.47 
 
 		 537 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  56.53 
 
 		 516 aa  594  1e-168  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  56.27 
 
 		 518 aa  590  1e-167  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  54.98 
 
 		 519 aa  583  1.0000000000000001e-165  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0810  cytochrome-c oxidase  54.8 
 
 		 518 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0311  cytochrome c oxidase, subunit I  52.52 
 
 		 535 aa  555  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  52.64 
 
 		 526 aa  548  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04020  cytochrome c oxidase, subunit I  51.8 
 
 		 534 aa  548  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  53.77 
 
 		 544 aa  548  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  53.18 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  53.2 
 
 		 534 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  53.18 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  53.28 
 
 		 537 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  53.18 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  53.18 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  53.02 
 
 		 534 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  53.18 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  53.18 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  53.02 
 
 		 534 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  53.18 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  51.57 
 
 		 543 aa  539  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  51.56 
 
 		 543 aa  539  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  52.99 
 
 		 535 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  51.96 
 
 		 526 aa  538  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  52.81 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  52.64 
 
 		 541 aa  536  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  50.82 
 
 		 527 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  52.17 
 
 		 544 aa  537  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  52.54 
 
 		 544 aa  538  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  52.77 
 
 		 529 aa  538  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  53.11 
 
 		 539 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  50.91 
 
 		 539 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  52.71 
 
 		 544 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  52.35 
 
 		 547 aa  537  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  52.08 
 
 		 556 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  53.47 
 
 		 535 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  52.19 
 
 		 537 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  52.15 
 
 		 544 aa  532  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  52.64 
 
 		 530 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  52.45 
 
 		 530 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  51.51 
 
 		 529 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  51.7 
 
 		 529 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  53.28 
 
 		 535 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  51.11 
 
 		 531 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  51.59 
 
 		 543 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  51.11 
 
 		 531 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  53.1 
 
 		 535 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  53.51 
 
 		 526 aa  529  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  51.7 
 
 		 529 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  51.64 
 
 		 537 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  51.89 
 
 		 569 aa  528  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  53.1 
 
 		 535 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  53.28 
 
 		 535 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  53.28 
 
 		 535 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  51.51 
 
 		 529 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  52.08 
 
 		 527 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  51.7 
 
 		 530 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  51.76 
 
 		 516 aa  528  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  50.45 
 
 		 535 aa  528  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>