More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1835 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  702    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  78.69 
 
 		 314 aa  508  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  83.04 
 
 		 340 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  80.41 
 
 		 338 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  83.04 
 
 		 336 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  76.51 
 
 		 297 aa  466  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  74.13 
 
 		 298 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  73.75 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  74.3 
 
 		 326 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  71 
 
 		 405 aa  401  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  73.79 
 
 		 331 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  73.9 
 
 		 326 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  72.31 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  57.72 
 
 		 367 aa  374  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  67.64 
 
 		 372 aa  374  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  64.81 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  65.22 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  65.25 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  69.65 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  67.98 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  69.72 
 
 		 318 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  68.24 
 
 		 327 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  65.9 
 
 		 365 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  66.14 
 
 		 263 aa  364  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  64.07 
 
 		 310 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  67.32 
 
 		 296 aa  362  8e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  63.53 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  67.34 
 
 		 303 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  66.53 
 
 		 316 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  66.67 
 
 		 383 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  65.13 
 
 		 299 aa  354  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  68.03 
 
 		 301 aa  352  7e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  65.27 
 
 		 304 aa  350  1e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  64.71 
 
 		 314 aa  349  4e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  64.73 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  64.14 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  61.8 
 
 		 296 aa  341  9e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  62.45 
 
 		 296 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  61.72 
 
 		 328 aa  338  9e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  62.35 
 
 		 294 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  62.35 
 
 		 294 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  62.35 
 
 		 294 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  59.07 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  55.69 
 
 		 295 aa  298  7e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  54.96 
 
 		 288 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  50.17 
 
 		 300 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  53.36 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  63.81 
 
 		 258 aa  295  7e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  60.78 
 
 		 304 aa  295  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  63.68 
 
 		 306 aa  295  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  61.02 
 
 		 310 aa  295  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  58.7 
 
 		 316 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  63.68 
 
 		 309 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  56.6 
 
 		 256 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  60.94 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  55.34 
 
 		 276 aa  293  3e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  61.36 
 
 		 285 aa  292  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  60.96 
 
 		 305 aa  292  7e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  59.15 
 
 		 304 aa  291  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  59.15 
 
 		 304 aa  291  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  52.46 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  59.49 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  56.6 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  56.52 
 
 		 307 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  60.27 
 
 		 513 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  55.37 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  59.64 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  57.37 
 
 		 304 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  60.81 
 
 		 305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  58.55 
 
 		 305 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  58.12 
 
 		 258 aa  289  6e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  57.2 
 
 		 269 aa  288  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  59.49 
 
 		 304 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  56.18 
 
 		 300 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  60.43 
 
 		 305 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  61.33 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  60.27 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  60.09 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  59.48 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  60.27 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  60.27 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  60.62 
 
 		 302 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  58.22 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  58.47 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  60.27 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  55 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  60.09 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  54.9 
 
 		 322 aa  286  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  55.83 
 
 		 281 aa  285  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  59.82 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  56.57 
 
 		 304 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  50.38 
 
 		 294 aa  285  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  49.28 
 
 		 293 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  61.01 
 
 		 300 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  56.69 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  56.69 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  56.69 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  58.77 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  56.3 
 
 		 316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  55.91 
 
 		 316 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>