More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1731 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  62.46 
 
 
574 aa  635    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  61.21 
 
 
588 aa  647    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  62.06 
 
 
578 aa  660    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  100 
 
 
592 aa  1146    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  60.52 
 
 
605 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  53.38 
 
 
571 aa  586  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  55.92 
 
 
583 aa  569  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  54.58 
 
 
586 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  47.79 
 
 
574 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  47.51 
 
 
585 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  53.42 
 
 
582 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  46.26 
 
 
588 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  45.53 
 
 
573 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  46.44 
 
 
585 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  37.98 
 
 
597 aa  362  9e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  42.39 
 
 
572 aa  362  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  37.59 
 
 
570 aa  343  5e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  40.03 
 
 
590 aa  342  8e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  36.94 
 
 
570 aa  336  7.999999999999999e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  37.93 
 
 
558 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  37.89 
 
 
591 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  39.69 
 
 
588 aa  297  3e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  38.3 
 
 
584 aa  274  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  37.52 
 
 
571 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  34.48 
 
 
575 aa  273  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  33.04 
 
 
583 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  36.7 
 
 
588 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  30.54 
 
 
569 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  30.54 
 
 
569 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  32.24 
 
 
626 aa  263  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  33.58 
 
 
577 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  32.5 
 
 
579 aa  258  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  33.81 
 
 
711 aa  256  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  31.84 
 
 
580 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  32.61 
 
 
586 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  31.88 
 
 
603 aa  251  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  30.85 
 
 
584 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  34.28 
 
 
596 aa  251  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  31.86 
 
 
560 aa  248  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  32.94 
 
 
581 aa  248  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  35.02 
 
 
584 aa  248  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  32.39 
 
 
573 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  33.63 
 
 
595 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  34.61 
 
 
730 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  32.5 
 
 
574 aa  243  7e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  32.74 
 
 
570 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  33.58 
 
 
565 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  32.56 
 
 
570 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  29.12 
 
 
608 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  34.47 
 
 
563 aa  238  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  33.09 
 
 
590 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  31.99 
 
 
568 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  35.96 
 
 
571 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  31.96 
 
 
590 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  32.31 
 
 
576 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  31.82 
 
 
568 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  32.17 
 
 
568 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  32.43 
 
 
578 aa  233  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  34.32 
 
 
573 aa  232  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  33.33 
 
 
582 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  33.03 
 
 
592 aa  230  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  31.49 
 
 
570 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  33.03 
 
 
703 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  31.97 
 
 
711 aa  227  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  31.9 
 
 
573 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  32.97 
 
 
586 aa  226  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  32.74 
 
 
576 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  30.66 
 
 
565 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  33.4 
 
 
557 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  31.27 
 
 
620 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  27.47 
 
 
573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  33.51 
 
 
581 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  31.16 
 
 
703 aa  220  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  30.9 
 
 
575 aa  220  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  33.27 
 
 
583 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  29.57 
 
 
603 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  31.86 
 
 
576 aa  216  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  32.91 
 
 
521 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  30.61 
 
 
599 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  33.09 
 
 
590 aa  210  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00670  sulfate transporter, putative  28.15 
 
 
835 aa  209  8e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.122332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  32.56 
 
 
556 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  30.31 
 
 
522 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  32.91 
 
 
521 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  31.68 
 
 
729 aa  208  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  30.6 
 
 
572 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0897  sulfate transporter  36.72 
 
 
690 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.675666  normal  0.770489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3641  sulfate permease  34.2 
 
 
708 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  29.02 
 
 
567 aa  204  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  31.2 
 
 
571 aa  204  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  33.83 
 
 
570 aa  204  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  32.03 
 
 
610 aa  203  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  31.98 
 
 
605 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  32.96 
 
 
569 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4103  sulphate transporter  34.06 
 
 
551 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  32.03 
 
 
610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.03 
 
 
610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.03 
 
 
610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.03 
 
 
610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.03 
 
 
610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>