231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1666 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 		 366 aa  729    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.792489 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  63.98 
 
 		 345 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  63.74 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  62.57 
 
 		 340 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.85 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.85 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.14 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.98 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.94 
 
 		 350 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.89 
 
 		 362 aa  352  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.41 
 
 		 353 aa  352  8e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  54.34 
 
 		 349 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.82 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.93 
 
 		 356 aa  345  6e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.24 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.43 
 
 		 363 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.02 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.77 
 
 		 347 aa  328  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  50.91 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  51.78 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  49.16 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  53.19 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.29 
 
 		 382 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
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NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  53.9 
 
 		 324 aa  310  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.3 
 
 		 363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_2506  hypothetical protein  49.41 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.524387 
 
 
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NC_007925  RPC_2807  hypothetical protein  53.67 
 
 		 368 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0544289  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.57 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.32 
 
 		 347 aa  288  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  40.94 
 
 		 454 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  43.08 
 
 		 457 aa  278  9e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  40.75 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.12 
 
 		 440 aa  276  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.32 
 
 		 437 aa  276  5e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  47.68 
 
 		 353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  48.58 
 
 		 347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.6 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.6 
 
 		 437 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
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NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  45.38 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
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NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  39.32 
 
 		 435 aa  269  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.86 
 
 		 437 aa  269  7e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.53 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.17 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.57 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  40.29 
 
 		 730 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  40.57 
 
 		 708 aa  266  5e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.48 
 
 		 440 aa  265  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  37.94 
 
 		 420 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  40 
 
 		 730 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.5 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  39.19 
 
 		 416 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.03 
 
 		 437 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.24 
 
 		 341 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.29 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  36.84 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  42.63 
 
 		 416 aa  257  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  41.25 
 
 		 483 aa  257  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.7 
 
 		 406 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  39.13 
 
 		 453 aa  256  4e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.75 
 
 		 433 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.96 
 
 		 433 aa  256  5e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.55 
 
 		 433 aa  255  8e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.94 
 
 		 411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.33 
 
 		 423 aa  252  6e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.14 
 
 		 454 aa  249  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.73 
 
 		 344 aa  249  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  42.41 
 
 		 527 aa  249  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.89 
 
 		 460 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.24 
 
 		 407 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  41.09 
 
 		 360 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.69 
 
 		 403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.59 
 
 		 344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.65 
 
 		 420 aa  246  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  39.49 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  41.23 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.23 
 
 		 415 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  39.94 
 
 		 439 aa  243  5e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.28 
 
 		 413 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.23 
 
 		 415 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.55 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.7 
 
 		 374 aa  240  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  41.44 
 
 		 439 aa  240  4e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.45 
 
 		 472 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.45 
 
 		 472 aa  238  9e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.6 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  39.1 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  39.1 
 
 		 473 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  39.1 
 
 		 473 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  39.1 
 
 		 473 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  39.1 
 
 		 473 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  39.1 
 
 		 473 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  39.1 
 
 		 473 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.53 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  39.1 
 
 		 473 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  39.1 
 
 		 473 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.6 
 
 		 436 aa  236  6e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  39.65 
 
 		 415 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.54 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.38 
 
 		 396 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  35.28 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
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