More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1665 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  315  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 172 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 159 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  42.41 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 		 173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  42.41 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  42.41 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  44.14 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  43.45 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  42.67 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  43.45 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5387  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138805  normal  0.471727 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  43.36 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 172 aa  117  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  45.03 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2701  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0065289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 163 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 163 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 163 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0704  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  40.13 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0737  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3640  transcriptional regulator, AsnC family  41.38 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3502  transcriptional regulator, AsnC family  40.69 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  41.22 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  44.12 
 
 		 189 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>