114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1612 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1612  ChaC family protein  100 
 
 		 178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2942  putative cation transport protein  52.27 
 
 		 180 aa  175  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0771654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1038  ChaC-like protein  52.33 
 
 		 180 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2210  ChaC family protein  54.24 
 
 		 182 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.956018 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2097  ChaC-like protein  49.12 
 
 		 175 aa  169  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.866958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1406  ChaC family protein  51.72 
 
 		 184 aa  164  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190446  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2287  ChaC-like protein  54.07 
 
 		 182 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.216291  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0963  ChaC family protein  53.49 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3259  ChaC-like protein  46.59 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1916  putative cation transport protein  43.79 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1991  cation transport protein, putative  43.79 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0990  ChaC family protein  42.86 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3576  ChaC family protein  42.61 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3248  ChaC family protein  46.25 
 
 		 181 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3560  ChaC family protein  43.68 
 
 		 173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3087  ChaC-like protein  44.38 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4445  ChaC family protein  45.06 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3869  ChaC family protein  40.91 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4863  ChaC-like protein  43.93 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372933  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2547  ChaC family protein  44.05 
 
 		 189 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0838  ChaC-like protein  43.35 
 
 		 192 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4031  transporter  40.78 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0947  ChaC-like protein  42.77 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5214  ChaC family protein  43.35 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.608281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1586  ChaC family protein  42.2 
 
 		 182 aa  120  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0671  ChaC-like protein  42.2 
 
 		 194 aa  120  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85299  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3535  ChaC family protein  43.64 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0580  ChaC-like protein  42.86 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1180  putative cation transport protein chaC-related  38.67 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1179  ChaC family protein  41.24 
 
 		 231 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0993  ChaC family protein  41.52 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0174  ChaC-like protein  39.78 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.331438  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1050  ChaC family protein  38.82 
 
 		 231 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0409  ChaC family protein  40.61 
 
 		 219 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2776  ChaC-like protein  40.56 
 
 		 258 aa  104  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3332  ChaC family protein  39.52 
 
 		 245 aa  104  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0627  putative ChaC-like protein  39.52 
 
 		 237 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0017  ChaC family protein  42.53 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.189731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1214  ChaC family protein  38.82 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296415  normal  0.688682 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0588  ChaC-related protein  38.79 
 
 		 210 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3223  ChaC family protein  39.05 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770321  normal  0.203555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6012  ChaC family protein  39.52 
 
 		 245 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0222  ChaC-related protein  38.18 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0886  hypothetical protein  38.18 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2724  ChaC family protein  38.18 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2354  ChaC family protein  38.18 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0705  ChaC family protein  38.18 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0720  ChaC family protein  38.18 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2434  ChaC family protein  38.18 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2428  ChaC family protein  36.63 
 
 		 238 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.216984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1368  chaC protein  36.63 
 
 		 238 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0977707  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1922  chaC protein  36.63 
 
 		 231 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522557  normal  0.0428933 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1794  ChaC family protein  36.57 
 
 		 224 aa  95.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1701  chaC protein  36.63 
 
 		 231 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2918  ChaC family protein  36.26 
 
 		 246 aa  94.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2030  ChaC family protein  37.28 
 
 		 231 aa  94  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.625962  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5239  ChaC-related protein  35.98 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5351  ChaC family protein  37.06 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2084  ChaC-like protein  36.97 
 
 		 210 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.704281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2696  ChaC family protein  36.97 
 
 		 210 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0640331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2443  ChaC family protein  38.41 
 
 		 252 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2724  ChaC family protein  36.97 
 
 		 210 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6024  ChaC-like protein  37.72 
 
 		 210 aa  92  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1758  ChaC family protein  37.08 
 
 		 226 aa  92  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1326  chaC protein  36.05 
 
 		 238 aa  92  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0602  ChaC family protein  36.36 
 
 		 210 aa  92  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2405  ChaC family protein  36.05 
 
 		 238 aa  92  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1385  chaC protein  36.05 
 
 		 238 aa  92  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0729  ChaC family protein  37.8 
 
 		 249 aa  91.7  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.740634  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0799  ChaC family protein  37.8 
 
 		 249 aa  91.3  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496231  normal  0.444522 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2613  ChaC family protein  37.72 
 
 		 205 aa  91.3  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.303262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2265  ChaC family protein  35.63 
 
 		 228 aa  91.3  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0304  ChaC-like protein  35.98 
 
 		 222 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2749  ChaC family protein  37.72 
 
 		 210 aa  90.9  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0164562  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0277  ChaC family protein  40.12 
 
 		 246 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3813  ChaC family protein  34.27 
 
 		 191 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2571  ChaC family protein  35.63 
 
 		 228 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0782  hypothetical protein  35.98 
 
 		 248 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5272  ChaC family protein  34.48 
 
 		 216 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01196  regulatory protein for cation transport  34.88 
 
 		 238 aa  89  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01206  hypothetical protein  34.88 
 
 		 238 aa  89  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5034  ChaC family protein  33.91 
 
 		 216 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5120  ChaC family protein  34.48 
 
 		 216 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5452  ChaC-like protein  34.15 
 
 		 222 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00716931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2888  ChaC-like protein  32.95 
 
 		 228 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1135  cation transporter  34.52 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.673266  normal  0.863519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2330  ChaC family protein  34.08 
 
 		 231 aa  85.9  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5111  hypothetical protein  34.1 
 
 		 228 aa  84.7  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5211  ChaC family protein  33.33 
 
 		 185 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2920  ChaC family protein  36.36 
 
 		 242 aa  84.3  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.508921 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4923  ChaC-like protein  34.5 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5792  ChaC family protein  37.95 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000625495 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1704  ChaC family protein  34.3 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0825  ChaC-like protein  35.03 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0341641  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3941  ChaC family protein  33.71 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236923  normal  0.174216 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13383  predicted protein  35.68 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.823077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1879  ChaC family protein  35.2 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1662  ChaC family protein  33.52 
 
 		 239 aa  80.9  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.513252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2633  ChaC-like protein  35.59 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0613681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5575  ChaC family protein  33.14 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>